Software installed on Rocky 8: Difference between revisions

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Because this is a major OS update, we need to recompile all the applications and ensure that they work with the new version of OS.
Because this is a major OS update, we need to recompile all the applications and ensure that they work with the new version of OS.


Below is a list of the modules already installed on the the Rocky 8 system. More software packages continue to be installed. If the software you need is not in this list yet, please feel free to let us know. Alternatively, you could also install it on the new system once it is open to users.
Below is a list of the modules already installed on the Rocky 8 system. More software packages continue to be installed. If the software you need is not in this list yet, please feel free to let us know, if you would like us to install it centrally on the updated cluster.
 
All singularity containers available in /apps/singularity-images on the current Sapelo2 (CentOS 7) will continue to be available after the maintenance.
 


===List of software already installed centrally on the Rocky 8 system (new Sapelo2, available after the maintenance)===
===List of software already installed centrally on the Rocky 8 system (new Sapelo2, available after the maintenance)===


   3D-DNA/201008-foss-2021b-Python-2.7.18
 
   3-NA/201008-foss-2021b-Python-2.7.18
   ABySS/2.3.5-foss-2021b
   ABySS/2.3.5-foss-2021b
   ACTC/1.1-GCCcore-11.2.0
   ACTC/1.1-GCCcore-11.2.0
   ADMIXTURE/1.3.0
   AMIXTURE/1.3.0
   AGAT/0.9.2-GCC-11.2.0
   AGAT/0.9.2-GCC-11.2.0
   AGAT/1.1.0                                          (D)
   AGAT/1.1.0                                           
   AMOS/3.1.0-foss-2021b
   AMOS/3.1.0-foss-2021b
   ANTLR/2.7.7-GCCcore-11.2.0-Java-11
   ANTLR/2.7.7-GCCcore-11.2.0-Java-11
Line 23: Line 27:
   ASTRAL/5.7.8-Java-1.8.0_241
   ASTRAL/5.7.8-Java-1.8.0_241
   ATK/2.36.0-GCCcore-11.2.0
   ATK/2.36.0-GCCcore-11.2.0
   ATK/2.38.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   ATK/2.38.0-GCCcore-11.3.0                           
   AUGUSTUS/3.4.0-foss-2021b
   AUGUSTUS/3.4.0-foss-2021b
   Amber/22.0-foss-2021b-AmberTools-22.3-CUDA-11.4.1
  AUGUSTUS/3.5.0-foss-2022a                         
  AlignGraph/2023-03-02-GCC-8.3.0
  AlphaFold/2.3.4-foss-2022a-CUA-11.7.0-ColabFold
   Amber/22.0-foss-2021b-AmberTools-22.3-CUA-11.4.1
   Anaconda3/2022.10
   Anaconda3/2022.10
   Archive-Zip/1.68-GCCcore-11.2.0
   Archive-Zip/1.68-GCCcore-11.2.0
   Armadillo/11.4.3-foss-2021b
   Armadillo/11.4.3-foss-2021b
  Armadillo/11.4.3-foss-2022a                       
   Arrow/8.0.0-foss-2021b
   Arrow/8.0.0-foss-2021b
   Autoconf/2.69-GCCcore-8.3.0
   Autoconf/2.69-GCCcore-8.3.0
Line 34: Line 42:
   Autoconf/2.71-GCCcore-11.2.0
   Autoconf/2.71-GCCcore-11.2.0
   Autoconf/2.71-GCCcore-11.3.0
   Autoconf/2.71-GCCcore-11.3.0
   Autoconf/2.71-GCCcore-12.2.0                        (D)
   Autoconf/2.71-GCCcore-12.2.0                         
   Automake/1.16.1-GCCcore-8.3.0
   Automake/1.16.1-GCCcore-8.3.0
   Automake/1.16.2-GCCcore-10.2.0
   Automake/1.16.2-GCCcore-10.2.0
   Automake/1.16.4-GCCcore-11.2.0
   Automake/1.16.4-GCCcore-11.2.0
   Automake/1.16.5-GCCcore-11.3.0
   Automake/1.16.5-GCCcore-11.3.0
   Automake/1.16.5-GCCcore-12.2.0                      (D)
   Automake/1.16.5-GCCcore-12.2.0                       
   Autotools/20180311-GCCcore-8.3.0
   Autotools/20180311-GCCcore-8.3.0
   Autotools/20200321-GCCcore-10.2.0
   Autotools/20200321-GCCcore-10.2.0
   Autotools/20210726-GCCcore-11.2.0
   Autotools/20210726-GCCcore-11.2.0
   Autotools/20220317-GCCcore-11.3.0
   Autotools/20220317-GCCcore-11.3.0
   Autotools/20220317-GCCcore-12.2.0                  (D)
   Autotools/20220317-GCCcore-12.2.0                   
   BBMap/38.98-GCC-11.2.0
   BBMap/38.98-GCC-11.2.0
   BCFtools/1.14-GCC-11.2.0
   BCFtools/1.14-GCC-11.2.0
   BEDOPS/2.4.41-foss-2021b
   BCFtools/1.15.1-GCC-11.3.0                         
   BEDTools/2.30.0-GCC-11.2.0
  BEOPS/2.4.41-foss-2021b
   BETools/2.30.0-GCC-11.2.0
   BLAST+/2.2.31
   BLAST+/2.2.31
   BLAST+/2.12.0-gompi-2021b
   BLAST+/2.12.0-gompi-2021b
   BLAST+/2.13.0-gompi-2021b
   BLAST+/2.13.0-gompi-2021b
   BLAST+/2.13.0-gompi-2022a                          (D)
   BLAST+/2.13.0-gompi-2022a                           
   BLAST/2.2.26-Linux_x86_64
   BLAST/2.2.26-Linux_x86_64
   BLAT/3.5-GCC-11.2.0
   BLAT/3.5-GCC-11.2.0
   BLAT/3.7-GCC-11.3.0                                (D)
   BLAT/3.7-GCC-11.3.0                                 
   BLIS/0.8.1-GCC-11.2.0
   BLIS/0.8.1-GCC-11.2.0
   BLIS/0.9.0-GCC-11.3.0                              (D)
   BLIS/0.9.0-GCC-11.3.0                               
   BRAKER/2.1.6-foss-2021b
   BRAKER/2.1.6-foss-2021b
   BRIG/0.95-gompi-2021b-Java-1.8.0_241
   BRIG/0.95-gompi-2021b-Java-1.8.0_241
Line 63: Line 72:
   BWA/0.7.17-GCCcore-11.2.0
   BWA/0.7.17-GCCcore-11.2.0
   BamTools/2.5.2-GCC-11.2.0
   BamTools/2.5.2-GCC-11.2.0
  BamTools/2.5.2-GCC-11.3.0                         
   BamUtil/1.0.15-foss-2021b
   BamUtil/1.0.15-foss-2021b
   Bandage/0.9.0-GCCcore-11.2.0
   Bandage/0.9.0-GCCcore-11.2.0
Line 68: Line 78:
   Bazel/3.7.2-GCCcore-11.2.0
   Bazel/3.7.2-GCCcore-11.2.0
   Bazel/4.2.2-GCCcore-11.2.0
   Bazel/4.2.2-GCCcore-11.2.0
   Bazel/5.1.1-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Bazel/5.1.1-GCCcore-11.3.0                           
   Beagle/5.4.22Jul22.46e-Java-11
   Beagle/5.4.22Jul22.46e-Java-11
   Beast/2.7.1-foss-2021b-CUDA-11.4.1
   Beast/2.7.1-foss-2021b-CUA-11.4.1
   BigDFT/1.9.1-foss-2021b
   BigFT/1.9.1-foss-2021b
   Bio-DB-HTS/3.01-GCC-11.2.0
   Bio-B-HTS/3.01-GCC-11.2.0
   BioPerl/1.7.8-GCCcore-11.2.0
   BioPerl/1.7.8-GCCcore-11.2.0
  BioPerl/1.7.8-GCCcore-11.3.0                       
   Biopython/1.79-foss-2021b
   Biopython/1.79-foss-2021b
   Biopython/1.79-foss-2022a
   Biopython/1.79-foss-2022a
   Biopython/1.81-foss-2021b                          (D)
   Biopython/1.81-foss-2021b                           
   Bismark/0.23.1-foss-2021b
   Bismark/0.23.1-foss-2021b
   Bison/3.3.2-GCCcore-8.3.0
   Bison/3.3.2-GCCcore-8.3.0
Line 84: Line 95:
   Bison/3.8.2-GCCcore-11.3.0
   Bison/3.8.2-GCCcore-11.3.0
   Bison/3.8.2-GCCcore-12.2.0
   Bison/3.8.2-GCCcore-12.2.0
   Bison/3.8.2                                        (D)
   Bison/3.8.2                                         
   Blosc/1.21.3-GCCcore-11.2.0
   Blosc/1.21.3-GCCcore-11.2.0
  Boost.MPI/1.79.0-gompi-2022a
   Boost.Python/1.77.0-GCC-11.2.0
   Boost.Python/1.77.0-GCC-11.2.0
   Boost/1.75.0-GCC-11.2.0
   Boost/1.75.0-GCC-11.2.0
   Boost/1.77.0-GCC-11.2.0
   Boost/1.77.0-GCC-11.2.0
   Boost/1.79.0-GCC-11.3.0                            (D)
   Boost/1.79.0-GCC-11.3.0                             
  Bottleneck/1.3.7-foss-2022a
   Bowtie/1.3.1-GCC-11.2.0
   Bowtie/1.3.1-GCC-11.2.0
   Bowtie/1.3.1-GCC-11.3.0                            (D)
   Bowtie/1.3.1-GCC-11.3.0                             
  Bowtie2/2.4.1-GCC-8.3.0
   Bowtie2/2.4.4-GCC-11.2.0
   Bowtie2/2.4.4-GCC-11.2.0
   Bowtie2/2.4.5-GCC-11.2.0
   Bowtie2/2.4.5-GCC-11.2.0
   Bowtie2/2.4.5-GCC-11.3.0                            (D)
   Bowtie2/2.4.5-GCC-11.3.0                             
   Bracken/2.7-GCCcore-11.2.0
   Bracken/2.7-GCCcore-11.2.0
   Brotli/1.0.9-GCCcore-11.2.0
   Brotli/1.0.9-GCCcore-11.2.0
   Brotli/1.0.9-GCCcore-11.3.0                        (D)
   Brotli/1.0.9-GCCcore-11.3.0                         
   CD-HIT/4.8.1-GCC-11.2.0
   C-HIT/4.8.1-GCC-11.2.0
   CD-HIT/4.8.1-GCC-11.3.0                            (D)
   C-HIT/4.8.1-GCC-11.3.0                             
   CFITSIO/3.49-GCCcore-11.2.0
   CFITSIO/3.49-GCCcore-11.2.0
   CGAL/4.14.3-gompi-2021b
   CGAL/4.14.3-gompi-2021b
Line 107: Line 121:
   CMake/3.22.1-GCCcore-11.2.0
   CMake/3.22.1-GCCcore-11.2.0
   CMake/3.23.1-GCCcore-11.3.0
   CMake/3.23.1-GCCcore-11.3.0
   CMake/3.24.3-GCCcore-11.3.0                        (D)
   CMake/3.24.3-GCCcore-11.3.0                         
   CUDA/11.3.1
   CUA/11.3.1
   CUDA/11.4.1
   CUA/11.4.1
   CUDA/11.7.0
   CUA/11.7.0
   CUDA/12.0.0                                        (D)
   CUA/12.0.0                                         
   CapnProto/0.9.1-GCCcore-11.2.0
   CapnProto/0.9.1-GCCcore-11.2.0
   CellRanger/7.0.0
   CellRanger/7.0.0
   Centrifuge/1.0.4-gompi-2021b
   Centrifuge/1.0.4-gompi-2021b
   Cereal/1.3.0
   Cereal/1.3.0
  CheMPS2/1.8.11-foss-2021b
   Check/0.15.2-GCCcore-11.2.0
   Check/0.15.2-GCCcore-11.2.0
   CheckM/1.1.3-foss-2021b
   CheckM/1.1.3-foss-2021b
Line 124: Line 139:
   ClustalW2/2.1-GCC-11.2.0
   ClustalW2/2.1-GCC-11.2.0
   Consed/29.0-foss-2021b
   Consed/29.0-foss-2021b
  Consed/29.0-foss-2022a                             
   CoordgenLibs/3.0.1-gompi-2021b
   CoordgenLibs/3.0.1-gompi-2021b
   CppUnit/1.15.1-GCCcore-11.2.0
   CppUnit/1.15.1-GCCcore-11.2.0
   Cufflinks/20190706-GCC-11.2.0
   Cufflinks/20190706-GCC-11.2.0
  Cython/0.27.3-GCCcore-11.3.0-Python-2.7.18
   Cytoscape/3.9.1-Java-11
   Cytoscape/3.9.1-Java-11
   DB/18.1.32-GCCcore-8.3.0
   B/18.1.32-GCCcore-8.3.0
   DB/18.1.40-GCCcore-10.2.0
   B/18.1.40-GCCcore-10.2.0
   DB/18.1.40-GCCcore-11.2.0
   B/18.1.40-GCCcore-11.2.0
   DB/18.1.40-GCCcore-11.3.0
   B/18.1.40-GCCcore-11.3.0
   DB/18.1.40-GCCcore-12.2.0                          (D)
   B/18.1.40-GCCcore-12.2.0                           
   DBD-mysql/4.050-GCC-11.2.0
   B-mysql/4.050-GCC-11.2.0
   DB_File/1.857-GCCcore-11.2.0
   B_File/1.857-GCCcore-11.2.0
   DBus/1.13.18-GCCcore-11.2.0
   B_File/1.858-GCCcore-11.3.0                       
   DBus/1.14.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
  Bus/1.13.18-GCCcore-11.2.0
   DIAMOND/2.0.13-GCC-11.2.0
   Bus/1.14.0-GCCcore-11.3.0                           
   DIAMOND/2.0.15-GCC-11.2.0
   IAMON/2.0.13-GCC-11.2.0
   DIAMOND/2.1.0-GCC-11.3.0                            (D)
   IAMON/2.0.15-GCC-11.2.0
   DataWarrior/5.5.0
   IAMON/2.1.0-GCC-11.3.0                             
   DendroPy/4.5.2-GCCcore-11.2.0
   ataWarrior/5.5.0
   Deve-Size/0.83-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   endroPy/4.5.2-GCCcore-11.2.0
   DockQ/1.0-foss-2022a
   eve-Size/0.83-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   Doxygen/1.9.1-GCCcore-11.2.0
   ockQ/1.0-foss-2022a
   Doxygen/1.9.4-GCCcore-11.3.0                        (D)
   oxygen/1.9.1-GCCcore-11.2.0
   oxygen/1.9.4-GCCcore-11.3.0                         
   ELPA/2021.11.001-foss-2021b
   ELPA/2021.11.001-foss-2021b
   EMBOSS/6.6.0-foss-2021b
   EMBOSS/6.6.0-foss-2021b
Line 152: Line 170:
   Eigen/3.3.9-GCCcore-11.2.0
   Eigen/3.3.9-GCCcore-11.2.0
   Eigen/3.4.0-GCCcore-11.2.0
   Eigen/3.4.0-GCCcore-11.2.0
   Eigen/3.4.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Eigen/3.4.0-GCCcore-11.3.0                           
   EnTAP/0.10.8-beta-foss-2021b
   EnTAP/0.10.8-beta-foss-2021b
   Exonerate/2.4.0-GCC-11.2.0
   Exonerate/2.4.0-GCC-11.2.0
  Exonerate/2.4.0-GCC-11.3.0                         
   FASTX-Toolkit/0.0.14-GCC-11.2.0
   FASTX-Toolkit/0.0.14-GCC-11.2.0
   FFTW.MPI/3.3.10-gompi-2022a
   FFTW.MPI/3.3.10-gompi-2022a
   FFTW/3.3.8-gompi-2019b
   FFTW/3.3.8-gompi-2019b
   FFTW/3.3.10-GCC-11.3.0
   FFTW/3.3.10-GCC-11.3.0
   FFTW/3.3.10-gompi-2021b                            (D)
   FFTW/3.3.10-gompi-2021b                             
   FFmpeg/4.3.2-GCCcore-11.2.0
   FFmpeg/4.3.2-GCCcore-11.2.0
   FLAC/1.3.3-GCCcore-11.2.0
   FLAC/1.3.3-GCCcore-11.2.0
   FLAC/1.3.4-GCCcore-11.3.0                          (D)
   FLAC/1.3.4-GCCcore-11.3.0                           
   FLASH/2.2.00-GCC-11.2.0
   FLASH/2.2.00-GCC-11.2.0
   FLTK/1.3.7-GCCcore-11.2.0
   FLTK/1.3.7-GCCcore-11.2.0
Line 172: Line 191:
   FastTree/2.1.11-GCCcore-11.2.0
   FastTree/2.1.11-GCCcore-11.2.0
   Flask/2.0.2-GCCcore-11.2.0
   Flask/2.0.2-GCCcore-11.2.0
   Flask/2.2.2-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Flask/2.2.2-GCCcore-11.3.0                           
   FlexiBLAS/3.0.4-GCC-11.2.0
   FlexiBLAS/3.0.4-GCC-11.2.0
   FlexiBLAS/3.2.0-GCC-11.3.0                          (D)
   FlexiBLAS/3.2.0-GCC-11.3.0                           
   Flye/2.9.1-GCC-11.2.0
   Flye/2.9.1-GCC-11.2.0
   FragGeneScan/1.31-GCCcore-11.2.0
   FragGeneScan/1.31-GCCcore-11.2.0
Line 180: Line 199:
   FreeSurfer/7.4.1-foss-2021b
   FreeSurfer/7.4.1-foss-2021b
   FriBidi/1.0.10-GCCcore-11.2.0
   FriBidi/1.0.10-GCCcore-11.2.0
   FriBidi/1.0.12-GCCcore-11.3.0                      (D)
   FriBidi/1.0.12-GCCcore-11.3.0                       
   GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.2.0-Java-11
   GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.2.0-Java-11
   GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.2.0-Java-13.0.2
   GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.2.0-Java-13.0.2
   GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.3.0-Java-11                (D)
   GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.3.0-Java-11                 
   GCC/8.3.0
   GCC/8.3.0
   GCC/10.2.0
   GCC/10.2.0
   GCC/11.2.0
   GCC/11.2.0
   GCC/11.3.0
   GCC/11.3.0
   GCC/12.2.0                                          (D)
   GCC/12.2.0                                           
   GCCcore/8.3.0
   GCCcore/8.3.0
   GCCcore/10.2.0
   GCCcore/10.2.0
   GCCcore/11.2.0
   GCCcore/11.2.0
   GCCcore/11.3.0
   GCCcore/11.3.0
   GCCcore/12.2.0                                      (D)
   GCCcore/12.2.0                                       
   GD/2.75-GCCcore-11.2.0
   G/2.75-GCCcore-11.2.0
   GDAL/3.3.2-foss-2021b
   GAL/3.3.2-foss-2021b
   GDAL/3.5.0-foss-2022a                              (D)
   GAL/3.5.0-foss-2022a                               
   GDRCopy/2.3-GCCcore-11.2.0
   GRCopy/2.3-GCCcore-11.2.0
   GDRCopy/2.3-GCCcore-11.3.0                          (D)
   GRCopy/2.3-GCCcore-11.3.0                           
  GEM/1.5.1-foss-2022a
   GEOS/3.9.1-GCC-11.2.0
   GEOS/3.9.1-GCC-11.2.0
   GEOS/3.10.3-GCC-11.3.0                              (D)
   GEOS/3.10.3-GCC-11.3.0                               
   GLPK/5.0-GCCcore-11.2.0
   GLPK/5.0-GCCcore-11.2.0
   GLPK/5.0-GCCcore-11.3.0                            (D)
   GLPK/5.0-GCCcore-11.3.0                             
   GLib/2.69.1-GCCcore-11.2.0
   GLib/2.69.1-GCCcore-11.2.0
   GLib/2.72.1-GCCcore-11.3.0                          (D)
   GLib/2.72.1-GCCcore-11.3.0                           
   GLibmm/2.66.4-GCCcore-11.2.0
   GLibmm/2.66.4-GCCcore-11.2.0
   GMAP-GSNAP/2021-21-17-GCC-11.2.0
   GMAP-GSNAP/2021-21-17-GCC-11.2.0
   GMAP-GSNAP/2023-02-17-GCC-11.3.0                    (D)
   GMAP-GSNAP/2023-02-17-GCC-11.3.0                     
   GMP/6.1.2-GCCcore-8.3.0
   GMP/6.1.2-GCCcore-8.3.0
   GMP/6.2.1-GCCcore-11.2.0
   GMP/6.2.1-GCCcore-11.2.0
   GMP/6.2.1-GCCcore-11.3.0                            (D)
   GMP/6.2.1-GCCcore-11.3.0                             
   GObject-Introspection/1.68.0-GCCcore-11.2.0
   GObject-Introspection/1.68.0-GCCcore-11.2.0
   GObject-Introspection/1.72.0-GCCcore-11.3.0        (D)
   GObject-Introspection/1.72.0-GCCcore-11.3.0         
   GROMACS/2021.5-foss-2021b-CUDA-11.4.1-PLUMED-2.8.0
   GROMACS/2021.5-foss-2021b-CUA-11.4.1-PLUME-2.8.0
   GSL/2.7-GCC-11.2.0
   GSL/2.7-GCC-11.2.0
   GSL/2.7-GCC-11.3.0                                  (D)
   GSL/2.7-GCC-11.3.0                                   
   GST-plugins-base/1.18.5-GCC-11.2.0
   GST-plugins-base/1.18.5-GCC-11.2.0
   GStreamer/1.18.5-GCC-11.2.0
   GStreamer/1.18.5-GCC-11.2.0
Line 223: Line 243:
   GTS/0.7.6-GCCcore-11.2.0
   GTS/0.7.6-GCCcore-11.2.0
   Gdk-Pixbuf/2.42.6-GCCcore-11.2.0
   Gdk-Pixbuf/2.42.6-GCCcore-11.2.0
   Gdk-Pixbuf/2.42.8-GCCcore-11.3.0                    (D)
   Gdk-Pixbuf/2.42.8-GCCcore-11.3.0                     
   GeneMark-ET/4.71-GCCcore-11.2.0
   GeneMark-ET/4.71-GCCcore-11.2.0
  GeneMark-ET/4.71-GCCcore-11.3.0                   
   GeneMarkS-T/5.1-GCCcore-11.2.0
   GeneMarkS-T/5.1-GCCcore-11.2.0
   Genome/05012020-foss-2021b
   Genome/05012020-foss-2021b
  Genome/05012020-foss-2022a                         
   GenomeThreader/1.7.3-Linux_x86_64-64bit
   GenomeThreader/1.7.3-Linux_x86_64-64bit
   GenomeTools/1.6.2-GCC-11.2.0
   GenomeTools/1.6.2-GCC-11.2.0
   GffCompare/0.12.6-GCC-11.2.0
   GffCompare/0.12.6-GCC-11.2.0
   Ghostscript/9.54.0-GCCcore-11.2.0
   Ghostscript/9.54.0-GCCcore-11.2.0
   Ghostscript/9.56.1-GCCcore-11.3.0                  (D)
   Ghostscript/9.56.1-GCCcore-11.3.0                   
   GitPython/3.1.24-GCCcore-11.2.0
   GitPython/3.1.24-GCCcore-11.2.0
   GlimmerHMM/3.0.4c-GCC-11.2.0
   GlimmerHMM/3.0.4c-GCC-11.2.0
Line 238: Line 260:
   Grace/5.1.25-foss-2021b
   Grace/5.1.25-foss-2021b
   Graphviz/2.50.0-GCCcore-11.2.0
   Graphviz/2.50.0-GCCcore-11.2.0
   Guile/3.0.7-GCCcore-11.2.0
  Guile/1.8.8-GCCcore-8.3.0
   HDF/4.2.15-GCCcore-11.2.0
   Guile/3.0.7-GCCcore-11.2.0                        
   HDF/4.2.15-GCCcore-11.3.0                          (D)
   HF/4.2.15-GCCcore-11.2.0
   HDF5/1.10.8-gompi-2021b
   HF/4.2.15-GCCcore-11.3.0                           
   HDF5/1.10.8-gompi-2022a
   HF5/1.10.8-gompi-2021b
   HDF5/1.12.1-gompi-2021b
   HF5/1.10.8-gompi-2022a
   HDF5/1.12.2-gompi-2022a                            (D)
   HF5/1.12.1-gompi-2021b
   HF5/1.12.2-gompi-2022a                             
   HEC-RAS/6.10
   HEC-RAS/6.10
   HH-suite/3.3.0-gompi-2021b
   HH-suite/3.3.0-gompi-2021b
  HH-suite/3.3.0-gompi-2022a                         
   HISAT2/2.2.1-gompi-2021b
   HISAT2/2.2.1-gompi-2021b
   HISAT2/2.2.1-gompi-2022a                            (D)
   HISAT2/2.2.1-gompi-2022a                             
   HMMER/3.3.2-gompi-2021b
   HMMER/3.3.2-gompi-2021b
   HMMER/3.3.2-gompi-2022a                            (D)
   HMMER/3.3.2-gompi-2022a                             
   HPL/2.3-foss-2021b
   HPL/2.3-foss-2021b
   HTSeq/2.0.2-foss-2021b
   HTSeq/2.0.2-foss-2021b
   HTSlib/1.9-GCC-11.2.0
   HTSlib/1.9-GCC-11.2.0
   HTSlib/1.14-GCC-11.2.0
   HTSlib/1.14-GCC-11.2.0
   HTSlib/1.15.1-GCC-11.3.0                            (D)
   HTSlib/1.15.1-GCC-11.3.0                             
   HarfBuzz/2.8.2-GCCcore-11.2.0
   HarfBuzz/2.8.2-GCCcore-11.2.0
   HarfBuzz/4.2.1-GCCcore-11.3.0                      (D)
   HarfBuzz/4.2.1-GCCcore-11.3.0                       
  Homer/4.11-foss-2021b
   HyPhy/2.5.33-gompi-2021b
   HyPhy/2.5.33-gompi-2021b
  HybPiper/2.1.6-conda
   ICU/69.1-GCCcore-11.2.0
   ICU/69.1-GCCcore-11.2.0
   ICU/71.1-GCCcore-11.3.0                            (D)
   ICU/71.1-GCCcore-11.3.0                             
   IDBA-UD/1.1.3-GCC-11.2.0
   IBA-U/1.1.3-GCC-11.2.0
   IGV/2.16.1-Java-11
   IGV/2.16.1-Java-11
   IPython/7.26.0-GCCcore-11.2.0
   IPython/7.26.0-GCCcore-11.2.0
Line 267: Line 293:
   ISA-L/2.30.0-GCCcore-11.2.0
   ISA-L/2.30.0-GCCcore-11.2.0
   ImageMagick/7.1.0-4-GCCcore-11.2.0
   ImageMagick/7.1.0-4-GCCcore-11.2.0
   ImageMagick/7.1.0-37-GCCcore-11.3.0                (D)
   ImageMagick/7.1.0-37-GCCcore-11.3.0                 
   Infernal/1.1.4-foss-2021b
   Infernal/1.1.4-foss-2021b
   Infernal/1.1.4-foss-2022a                          (D)
   Infernal/1.1.4-foss-2022a                           
   InterProScan/5.62-94.0-foss-2021b
   InterProScan/5.62-94.0-foss-2021b
   JAGS/4.3.0-foss-2021b
   JAGS/4.3.0-foss-2021b
  JUnit/4.12-Java-1.8.0_241
   JasPer/2.0.33-GCCcore-11.2.0
   JasPer/2.0.33-GCCcore-11.2.0
   JasPer/2.0.33-GCCcore-11.3.0                        (D)
   JasPer/2.0.33-GCCcore-11.3.0                         
   Java/1.7.0_80
   Java/1.7.0_80
   Java/1.8.0_241
   Java/1.8.0_241
   Java/11.0.16                                        (11)
   Java/11.0.16                                         
   Java/13.0.2                                         (13)
   Java/13.0.2                                      
   Java/15.0.1                                         (15)
   Java/15.0.1                                      
   Java/17.0.6                                         (D:17)
   Java/17.0.6                                      
   Jellyfish/2.3.0-GCC-11.2.0
   Jellyfish/2.3.0-GCC-11.2.0
   Jellyfish/2.3.0-GCC-11.3.0                          (D)
   Jellyfish/2.3.0-GCC-11.3.0                           
   JsonCpp/1.9.4-GCCcore-11.2.0
   JsonCpp/1.9.4-GCCcore-11.2.0
   JsonCpp/1.9.5-GCCcore-11.3.0                        (D)
   JsonCpp/1.9.5-GCCcore-11.3.0                         
   Judy/1.0.5-GCCcore-11.2.0
   Judy/1.0.5-GCCcore-11.2.0
   Judy/1.0.5-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Judy/1.0.5-GCCcore-11.3.0                           
   Julia/1.8.2-linux-x86_64
   Julia/1.8.2-linux-x86_64
   Kalign/3.3.2-GCCcore-11.2.0
   Kalign/3.3.2-GCCcore-11.2.0
  Kalign/3.3.5-GCCcore-11.3.0                       
   Kent_tools/422-GCC-11.2.0
   Kent_tools/422-GCC-11.2.0
  KerasTuner/1.3.5-foss-2022a
   KronaTools/2.8.1-GCCcore-11.2.0
   KronaTools/2.8.1-GCCcore-11.2.0
   LAME/3.100-GCCcore-11.2.0
   LAME/3.100-GCCcore-11.2.0
   LAME/3.100-GCCcore-11.3.0                          (D)
   LAME/3.100-GCCcore-11.3.0                           
   LAMMPS/23Jun2022-foss-2021b-kokkos
   LAMMPS/23Jun2022-foss-2021b-kokkos
   LAPACK/3.10.1-GCC-11.2.0
   LAPACK/3.10.1-GCC-11.2.0
   LASTZ/1.04.15-foss-2021b
   LASTZ/1.04.15-foss-2021b
   LLVM/12.0.1-GCCcore-11.2.0
   LLVM/12.0.1-GCCcore-11.2.0
   LLVM/14.0.3-GCCcore-11.3.0                          (D)
   LLVM/14.0.3-GCCcore-11.3.0                           
   LMDB/0.9.29-GCCcore-11.2.0
   LMB/0.9.29-GCCcore-11.2.0
   LMDB/0.9.29-GCCcore-11.3.0                          (D)
   LMB/0.9.29-GCCcore-11.3.0                           
   LSD2/2.3-GCCcore-11.2.0
   LS2/2.3-GCCcore-11.2.0
   LTR_retriever/2.9.0-foss-2021b-RepeatMasker-4.1.4
   LTR_retriever/2.9.0-foss-2021b-RepeatMasker-4.1.4
   LTR_retriever/2.9.0-foss-2021b                      (D)
   LTR_retriever/2.9.0-foss-2021b                       
   LZO/2.10-GCCcore-11.2.0
   LZO/2.10-GCCcore-11.2.0
   LZO/2.10-GCCcore-11.3.0                            (D)
   LZO/2.10-GCCcore-11.3.0                             
   LibTIFF/4.3.0-GCCcore-11.2.0
   LibTIFF/4.3.0-GCCcore-11.2.0
   LibTIFF/4.3.0-GCCcore-11.3.0                        (D)
   LibTIFF/4.3.0-GCCcore-11.3.0                         
   LightGBM/3.3.5-foss-2021b-CUDA-11.4.1
   LightGBM/3.3.5-foss-2021b-CUA-11.4.1
   LightGBM/3.3.5-foss-2021b                          (D)
   LightGBM/3.3.5-foss-2021b                           
   LittleCMS/2.12-GCCcore-11.2.0
   LittleCMS/2.12-GCCcore-11.2.0
   LittleCMS/2.13.1-GCCcore-11.3.0                    (D)
   LittleCMS/2.13.1-GCCcore-11.3.0                     
   LoFreq/2.1.3.1-foss-2021b-Python-2.7.18
   LoFreq/2.1.3.1-foss-2021b-Python-2.7.18
   Lua/5.4.3-GCCcore-11.2.0
   Lua/5.4.3-GCCcore-11.2.0
Line 318: Line 347:
   M4/1.4.19-GCCcore-11.3.0
   M4/1.4.19-GCCcore-11.3.0
   M4/1.4.19-GCCcore-12.2.0
   M4/1.4.19-GCCcore-12.2.0
   M4/1.4.19                                          (D)
   M4/1.4.19                                           
   MACS2/2.2.7.1-foss-2021b
   MACS2/2.2.7.1-foss-2021b
   MAFFT/7.490-GCC-11.2.0-with-extensions
   MAFFT/7.490-GCC-11.2.0-with-extensions
   MAFFT/7.490-gompi-2021b-with-extensions            (D)
   MAFFT/7.490-gompi-2021b-with-extensions             
  MAKER/3.01.04-foss-2022a
   MCL/14.137-GCCcore-11.2.0
   MCL/14.137-GCCcore-11.2.0
   MEGAN/6.24.23-Java-17
   MEGAN/6.24.23-Java-17
   MEME/5.4.1-gompi-2021b
   MEME/5.4.1-gompi-2021b
   MEME/5.5.0-gompi-2021b                              (D)
   MEME/5.5.0-gompi-2021b                               
   METIS/5.1.0-GCCcore-11.2.0
   METIS/5.1.0-GCCcore-11.2.0
  METIS/5.1.0-GCCcore-11.3.0                         
   MMseqs2/13-45111-gompi-2021b
   MMseqs2/13-45111-gompi-2021b
   MMseqs2/14-7e284-gompi-2021b
   MMseqs2/14-7e284-gompi-2021b
   MMseqs2/14-7e284-gompi-2022a                        (D)
   MMseqs2/14-7e284-gompi-2022a                         
  MPACK/3.0.0-foss-2021b
   MPFR/4.1.0-GCCcore-11.2.0
   MPFR/4.1.0-GCCcore-11.2.0
   MPFR/4.1.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   MPFR/4.1.0-GCCcore-11.3.0                           
   MUMmer/4.0.0beta2-GCCcore-11.2.0
   MUMmer/4.0.0beta2-GCCcore-11.2.0
   MUMmer/4.0.0rc1-GCCcore-11.2.0                      (D)
   MUMmer/4.0.0rc1-GCCcore-11.2.0                       
   MUSCLE/3.8.31-GCCcore-11.2.0
   MUSCLE/3.8.31-GCCcore-11.2.0
   Make-Lastz-Chains/0.9.1
   Make-Lastz-Chains/0.9.1
   Mako/1.1.4-GCCcore-11.2.0
   Mako/1.1.4-GCCcore-11.2.0
   Mako/1.2.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Mako/1.2.0-GCCcore-11.3.0                           
   MariaDB/10.6.4-GCC-11.2.0
   MariaB-connector-c/3.2.2-GCCcore-11.2.0
   MariaDB/10.9.3-GCC-11.3.0                          (D)
  MariaB/10.6.4-GCC-11.2.0
   MariaB/10.9.3-GCC-11.3.0                           
   Mash/2.3-GCC-11.2.0
   Mash/2.3-GCC-11.2.0
  Medusa/1.6-foss-2021b-Python-3.9.6-Java-1.8.0_241
   Mesa/21.1.7-GCCcore-11.2.0
   Mesa/21.1.7-GCCcore-11.2.0
   Mesa/22.0.3-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Mesa/22.0.3-GCCcore-11.3.0                           
   Meson/0.55.3-GCCcore-11.2.0
   Meson/0.55.3-GCCcore-11.2.0
   Meson/0.58.2-GCCcore-11.2.0
   Meson/0.58.2-GCCcore-11.2.0
   Meson/0.62.1-GCCcore-11.3.0                        (D)
   Meson/0.62.1-GCCcore-11.3.0                         
   MetaEuk/6-GCC-11.2.0
   MetaEuk/6-GCC-11.2.0
  MinCE/0.4.2-GCCcore-8.3.0-Java-11
   Miniconda3/4.12.0
   Miniconda3/4.12.0
  Miniconda3/22.11.1-1                               
   Mirage/2.0.0-GCCcore-11.2.0
   Mirage/2.0.0-GCCcore-11.2.0
   MuTect/1.1.7-Java-1.7.0_80
   MuTect/1.1.7-Java-1.7.0_80
Line 353: Line 389:
   MySQL/8.0.34-glibc2.28
   MySQL/8.0.34-glibc2.28
   NASM/2.15.05-GCCcore-11.2.0
   NASM/2.15.05-GCCcore-11.2.0
   NASM/2.15.05-GCCcore-11.3.0                        (D)
   NASM/2.15.05-GCCcore-11.3.0                         
   NCCL/2.10.3-GCCcore-11.2.0-CUDA-11.4.1
   NCCL/2.10.3-GCCcore-11.2.0-CUA-11.4.1
  NCCL/2.12.12-GCCcore-11.3.0-CUA-11.7.0           
   NGS/2.10.9-GCCcore-11.2.0
   NGS/2.10.9-GCCcore-11.2.0
   NGS/2.11.2-GCCcore-11.2.0                          (D)
   NGS/2.11.2-GCCcore-11.2.0                           
   NLopt/2.7.0-GCCcore-11.2.0
   NLopt/2.7.0-GCCcore-11.2.0
   NLopt/2.7.1-GCCcore-11.3.0                          (D)
   NLopt/2.7.1-GCCcore-11.3.0                           
   NSPR/4.32-GCCcore-11.2.0
   NSPR/4.32-GCCcore-11.2.0
   NSS/3.69-GCCcore-11.2.0
   NSS/3.69-GCCcore-11.2.0
   NVHPC/22.11-CUDA-11.7.0
   NVHPC/22.11-CUA-11.7.0
   NVHPC/23.1-CUDA-12.0.0                              (D)
   NVHPC/23.1-CUA-12.0.0                               
   Nextflow/22.10.6
   Nextflow/22.10.6
   Ninja/1.10.2-GCCcore-11.2.0
   Ninja/1.10.2-GCCcore-11.2.0
   Ninja/1.10.2-GCCcore-11.3.0                        (D)
   Ninja/1.10.2-GCCcore-11.3.0                         
   ORCA/5.0.3-gompi-2021b
   ORCA/5.0.3-gompi-2021b
   OpenBLAS/0.3.7-GCC-8.3.0
   OpenBLAS/0.3.7-GCC-8.3.0
   OpenBLAS/0.3.18-GCC-11.2.0
   OpenBLAS/0.3.18-GCC-11.2.0
   OpenBLAS/0.3.20-GCC-11.3.0                          (D)
   OpenBLAS/0.3.20-GCC-11.3.0                           
   OpenBabel/3.1.1-gompi-2021b
   OpenBabel/3.1.1-gompi-2021b
   OpenCV/4.5.5-foss-2021b-contrib
   OpenCV/4.5.5-foss-2021b-contrib
   OpenEXR/3.1.1-GCCcore-11.2.0
   OpenEXR/3.1.1-GCCcore-11.2.0
   OpenJPEG/2.4.0-GCCcore-11.2.0
   OpenJPEG/2.4.0-GCCcore-11.2.0
   OpenJPEG/2.5.0-GCCcore-11.3.0                      (D)
   OpenJPEG/2.5.0-GCCcore-11.3.0                       
   OpenMM/7.5.1-foss-2021b-DeepMind-patch
   OpenMM/7.5.1-foss-2021b-eepMind-patch
  OpenMM/8.0.0-foss-2022a-CUA-11.7.0               
   OpenMPI/4.1.2-GCC-11.2.0-pmi2
   OpenMPI/4.1.2-GCC-11.2.0-pmi2
   OpenMPI/4.1.2-GCC-11.2.0
   OpenMPI/4.1.2-GCC-11.2.0
   OpenMPI/4.1.4-GCC-11.3.0
   OpenMPI/4.1.4-GCC-11.3.0
   OpenMPI/4.1.4-GCC-12.2.0                            (D)
   OpenMPI/4.1.4-GCC-12.2.0                             
   OpenPGM/5.2.122-GCCcore-11.2.0
   OpenPGM/5.2.122-GCCcore-11.2.0
   OpenSSL/1.1
   OpenSSL/1.1
Line 385: Line 423:
   PAML/4.9j-GCCcore-11.2.0
   PAML/4.9j-GCCcore-11.2.0
   PCRE/8.45-GCCcore-11.2.0
   PCRE/8.45-GCCcore-11.2.0
   PCRE/8.45-GCCcore-11.3.0                            (D)
   PCRE/8.45-GCCcore-11.3.0                             
   PCRE2/10.37-GCCcore-11.2.0
   PCRE2/10.37-GCCcore-11.2.0
   PCRE2/10.40-GCCcore-11.3.0                          (D)
   PCRE2/10.40-GCCcore-11.3.0                           
   PLINK/2.00a4-GCC-11.2.0
   PLINK/2.00a4-GCC-11.2.0
   PLUMED/2.7.3-foss-2021b
   PLUME/2.7.3-foss-2021b
   PLUMED/2.8.0-foss-2021b                            (D)
   PLUME/2.8.0-foss-2021b                             
   PMIx/3.1.5-GCCcore-10.2.0
   PMIx/3.1.5-GCCcore-10.2.0
   PMIx/4.1.0-GCCcore-11.2.0
   PMIx/4.1.0-GCCcore-11.2.0
   PMIx/4.1.2-GCCcore-11.3.0
   PMIx/4.1.2-GCCcore-11.3.0
   PMIx/4.2.2-GCCcore-12.2.0                          (D)
   PMIx/4.2.2-GCCcore-12.2.0                           
   PROJ/8.1.0-GCCcore-11.2.0
   PROJ/8.1.0-GCCcore-11.2.0
   PROJ/9.0.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   PROJ/9.0.0-GCCcore-11.3.0                           
  PSI4/1.7-foss-2021b
   PTarPmiR/0.1-foss-2021b-Python-3.9.6
   PTarPmiR/0.1-foss-2021b-Python-3.9.6
   Pango/1.48.8-GCCcore-11.2.0
   Pango/1.48.8-GCCcore-11.2.0
   Pango/1.50.7-GCCcore-11.3.0                        (D)
   Pango/1.50.7-GCCcore-11.3.0                         
   Perl/5.30.0-GCCcore-8.3.0-minimal
   Perl/5.30.0-GCCcore-8.3.0-minimal
   Perl/5.30.0-GCCcore-8.3.0
   Perl/5.30.0-GCCcore-8.3.0
Line 408: Line 447:
   Perl/5.34.1-GCCcore-11.3.0-minimal
   Perl/5.34.1-GCCcore-11.3.0-minimal
   Perl/5.34.1-GCCcore-11.3.0
   Perl/5.34.1-GCCcore-11.3.0
   Perl/5.36.0-GCCcore-12.2.0                          (D)
   Perl/5.36.0-GCCcore-12.2.0                           
   Phobius/1.01-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   Phobius/1.01-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   Phrap/0.990329-foss-2021b
   Phrap/0.990329-foss-2021b
  Phrap/0.990329-foss-2022a                         
   Phred/0.071220.c-foss-2021b
   Phred/0.071220.c-foss-2021b
  Phred/0.071220.c-foss-2022a                       
  Pillow-SIM/8.3.2-GCCcore-11.2.0
   Pillow/8.3.2-GCCcore-11.2.0
   Pillow/8.3.2-GCCcore-11.2.0
  Pillow/9.1.1-GCCcore-11.3.0                       
   Pilon/1.23-Java-11
   Pilon/1.23-Java-11
   PnetCDF/1.12.3-gompi-2021b
   PnetCF/1.12.3-gompi-2021b
   PyBioLib/1.1.988-GCCcore-11.3.0
   PyBioLib/1.1.988-GCCcore-11.3.0
   PyQt5/5.15.4-GCCcore-11.2.0
   PyQt5/5.15.4-GCCcore-11.2.0
   PyRosetta/4.release-339-GCCcore-11.2.0-Python-3.9.6
   PyRosetta/4.release-339-GCCcore-11.2.0-Python-3.9.6
   PyTorch/1.12.1-foss-2021b-CUDA-11.4.1
  PyTorch-Lightning/1.5.9-foss-2021b-CUA-11.4.1
   PyTorch/1.12.1-foss-2021b-CUA-11.4.1
   PyYAML/5.4.1-GCCcore-11.2.0
   PyYAML/5.4.1-GCCcore-11.2.0
   PyYAML/6.0-GCCcore-11.2.0
   PyYAML/6.0-GCCcore-11.2.0
   PyYAML/6.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   PyYAML/6.0-GCCcore-11.3.0                           
   Pysam/0.17.0-GCC-11.2.0
   Pysam/0.17.0-GCC-11.2.0
   Python/2.7.18-GCCcore-11.2.0-bare
   Python/2.7.18-GCCcore-11.2.0-bare
   Python/2.7.18-GCCcore-11.2.0
   Python/2.7.18-GCCcore-11.2.0
  Python/2.7.18-GCCcore-11.3.0
   Python/3.7.4-GCCcore-8.3.0
   Python/3.7.4-GCCcore-8.3.0
   Python/3.9.6-GCCcore-11.2.0-bare
   Python/3.9.6-GCCcore-11.2.0-bare
   Python/3.9.6-GCCcore-11.2.0
   Python/3.9.6-GCCcore-11.2.0
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   Python/3.10.4-GCCcore-11.3.0-bare
   Python/3.10.4-GCCcore-11.3.0                        (D)
   Python/3.10.4-GCCcore-11.3.0                         
  QIIME2/2023.2
   QUAST/5.0.2-foss-2021b
   QUAST/5.0.2-foss-2021b
   Qhull/2020.2-GCCcore-11.2.0
   Qhull/2020.2-GCCcore-11.2.0
  Qhull/2020.2-GCCcore-11.3.0                       
   Qt5/5.15.2-GCCcore-11.2.0
   Qt5/5.15.2-GCCcore-11.2.0
   QuantumESPRESSO/7.1-foss-2021b
   QuantumESPRESSO/7.1-foss-2021b
Line 437: Line 484:
   R/4.1.2-foss-2021b
   R/4.1.2-foss-2021b
   R/4.2.1-foss-2021b
   R/4.2.1-foss-2021b
   R/4.2.1-foss-2022a                                  (D)
   R/4.2.1-foss-2022a
  R/4.3.1-foss-2022a                                   
   RAxML/8.2.12-gompi-2021b-hybrid-avx2
   RAxML/8.2.12-gompi-2021b-hybrid-avx2
   RDKit/2022.03.5-foss-2021b
   RKit/2022.03.5-foss-2021b
   RE2/2022-02-01-GCCcore-11.2.0
   RE2/2022-02-01-GCCcore-11.2.0
  RE2/2022-06-01-GCCcore-11.3.0                     
   RECON/1.08-GCC-11.2.0
   RECON/1.08-GCC-11.2.0
   RMBlast/2.11.0-gompi-2021b
   RMBlast/2.11.0-gompi-2021b
   RMBlast/2.13.0-gompi-2021b                          (D)
   RMBlast/2.13.0-gompi-2021b
  RMBlast/2.13.0-gompi-2022a                          
   RSEM/1.3.3-foss-2021b
   RSEM/1.3.3-foss-2021b
   RSEM/1.3.3-foss-2022a                              (D)
   RSEM/1.3.3-foss-2022a                               
   Racon/1.5.0-GCCcore-11.2.0
   Racon/1.5.0-GCCcore-11.2.0
   RapidJSON/1.1.0-GCCcore-11.2.0
   RapidJSON/1.1.0-GCCcore-11.2.0
  RapidJSON/1.1.0-GCCcore-11.3.0                     
   RepeatMasker/4.1.2-p1-foss-2021b
   RepeatMasker/4.1.2-p1-foss-2021b
   RepeatMasker/4.1.4-foss-2021b                      (D)
   RepeatMasker/4.1.4-foss-2021b
  RepeatMasker/4.1.4-foss-2022a                        
   RepeatModeler/2.0.2a-foss-2021b
   RepeatModeler/2.0.2a-foss-2021b
   RepeatModeler/2.0.3-foss-2021b
   RepeatModeler/2.0.3-foss-2021b
   RepeatModeler/2.0.4-foss-2021b                      (D)
   RepeatModeler/2.0.4-foss-2021b                       
   RepeatProfiler/1.1-foss-2021b
   RepeatProfiler/1.1-foss-2021b
   RepeatScout/1.0.6-GCC-11.2.0
   RepeatScout/1.0.6-GCC-11.2.0
Line 458: Line 510:
   Ruby/3.0.5-GCCcore-11.2.0
   Ruby/3.0.5-GCCcore-11.2.0
   Rust/1.54.0-GCCcore-11.2.0
   Rust/1.54.0-GCCcore-11.2.0
   Rust/1.60.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Rust/1.60.0-GCCcore-11.3.0
  Rust/1.70.0-GCCcore-11.3.0                           
   SAMtools/0.1.20-GCC-11.2.0
   SAMtools/0.1.20-GCC-11.2.0
   SAMtools/1.6-GCC-11.2.0
   SAMtools/1.6-GCC-11.2.0
   SAMtools/1.14-GCC-11.2.0
   SAMtools/1.14-GCC-11.2.0
   SAMtools/1.16.1-GCC-11.3.0                          (D)
   SAMtools/1.16.1-GCC-11.3.0                           
   SCons/4.2.0-GCCcore-11.2.0
   SCons/4.2.0-GCCcore-11.2.0
   SEPP/4.5.1-foss-2021b
   SEPP/4.5.1-foss-2021b
Line 468: Line 521:
   SMRT-Link/12.0.0.177059-cli-tools-only
   SMRT-Link/12.0.0.177059-cli-tools-only
   SNAP-HMM/20190603-GCC-11.2.0
   SNAP-HMM/20190603-GCC-11.2.0
  SNAP-HMM/20221022-GCC-11.3.0                       
   SNAP/2.0.1-GCC-11.2.0
   SNAP/2.0.1-GCC-11.2.0
  SNPGenie/1.0-foss-2021b-Perl-5.34.0
   SPAdes/3.15.3-GCC-11.2.0
   SPAdes/3.15.3-GCC-11.2.0
   SPAdes/3.15.5-GCC-11.2.0-kmer300
   SPAdes/3.15.5-GCC-11.2.0-kmer300
   SPAdes/3.15.5-GCC-11.2.0                            (D)
   SPAdes/3.15.5-GCC-11.2.0                             
   SQANTI3/5.1.1
   SQANTI3/5.1.1
   SQLAlchemy/1.4.42-foss-2021b-Python-3.9.6
   SQLAlchemy/1.4.42-foss-2021b-Python-3.9.6
   SQLite/3.29.0-GCCcore-8.3.0
   SQLite/3.29.0-GCCcore-8.3.0
   SQLite/3.36-GCCcore-11.2.0
   SQLite/3.36-GCCcore-11.2.0
   SQLite/3.38.3-GCCcore-11.3.0                        (D)
   SQLite/3.38.3-GCCcore-11.3.0                         
   SRA-Toolkit/3.0.1-centos_linux64
   SRA-Toolkit/3.0.1-centos_linux64
   SRA-Toolkit/3.0.3-gompi-2022a                      (D)
   SRA-Toolkit/3.0.3-gompi-2022a                       
   SSW/1.1-GCCcore-11.2.0
   SSW/1.1-GCCcore-11.2.0
   STAR/2.7.10b-GCC-11.2.0
   STAR/2.7.10b-GCC-11.2.0
   STAR/2.7.10b-GCC-11.3.0                            (D)
   STAR/2.7.10b-GCC-11.3.0                             
   SWIG/4.0.2-GCCcore-11.2.0
   SWIG/4.0.2-GCCcore-11.2.0
  SWIG/4.0.2-GCCcore-11.3.0                         
   Salmon/0.8.2
   Salmon/0.8.2
   Salmon/1.9.0-GCC-11.2.0
   Salmon/1.9.0-GCC-11.2.0
   Salmon/1.9.0-GCC-11.3.0                            (D)
   Salmon/1.9.0-GCC-11.3.0                             
   ScaFaCoS/1.0.1-foss-2021b
   ScaFaCoS/1.0.1-foss-2021b
   ScaLAPACK/2.0.2-gompi-2019b
   ScaLAPACK/2.0.2-gompi-2019b
   ScaLAPACK/2.1.0-gompi-2021b-fb
   ScaLAPACK/2.1.0-gompi-2021b-fb
   ScaLAPACK/2.2.0-gompi-2022a-fb                      (D)
   ScaLAPACK/2.2.0-gompi-2022a-fb                       
   SciPy-bundle/2021.10-foss-2021b-Python-2.7.18
   SciPy-bundle/2021.10-foss-2021b-Python-2.7.18
   SciPy-bundle/2021.10-foss-2021b
   SciPy-bundle/2021.10-foss-2021b
  SciPy-bundle/2021.10-foss-2022a-Python-2.7.18
   SciPy-bundle/2022.05-foss-2021b
   SciPy-bundle/2022.05-foss-2021b
   SciPy-bundle/2022.05-foss-2022a                    (D)
   SciPy-bundle/2022.05-foss-2022a                     
   SeqKit/0.16.1
   SeqKit/0.16.1
   SeqKit/2.3.1                                        (D)
   SeqKit/2.3.1                                         
   SeqLib/1.2.0-GCC-11.2.0
   SeqLib/1.2.0-GCC-11.2.0
   Serf/1.3.9-GCCcore-11.2.0
   Serf/1.3.9-GCCcore-11.2.0
Line 502: Line 559:
   SignalP/4.1f-GCCcore-11.2.0
   SignalP/4.1f-GCCcore-11.2.0
   SignalP/5.0b-Linux
   SignalP/5.0b-Linux
   SignalP/6.0g-GCCcore-11.2.0-slow-sequential        (D)
   SignalP/6.0g-GCCcore-11.2.0-slow-sequential         
   Stacks/2.62-foss-2021b
   Stacks/2.62-foss-2021b
   StringTie/2.2.1-GCC-11.2.0
   StringTie/2.2.1-GCC-11.2.0
Line 509: Line 566:
   Subversion/1.14.1-GCCcore-11.2.0
   Subversion/1.14.1-GCCcore-11.2.0
   SuiteSparse/5.10.1-foss-2021b-METIS-5.1.0
   SuiteSparse/5.10.1-foss-2021b-METIS-5.1.0
  SuiteSparse/5.13.0-foss-2022a-METIS-5.1.0         
   Szip/2.1.1-GCCcore-11.2.0
   Szip/2.1.1-GCCcore-11.2.0
   Szip/2.1.1-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Szip/2.1.1-GCCcore-11.3.0                           
  TASSEL/5.2.44-Java-1.8.0_241
   TMHMM/2.0c-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   TMHMM/2.0c-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   TRF/4.09.1-GCCcore-11.2.0
   TRF/4.09.1-GCCcore-11.2.0
  TRF/4.09.1-GCCcore-11.3.0                         
   TWL-NINJA/0.97-cluster_only-GCC-11.2.0
   TWL-NINJA/0.97-cluster_only-GCC-11.2.0
   TWL-NINJA/0.98-cluster_only-GCC-11.2.0              (D)
   TWL-NINJA/0.98-cluster_only-GCC-11.2.0               
   Tcl/8.6.9-GCCcore-8.3.0
   Tcl/8.6.9-GCCcore-8.3.0
   Tcl/8.6.11-GCCcore-11.2.0
   Tcl/8.6.11-GCCcore-11.2.0
   Tcl/8.6.12-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Tcl/8.6.12-GCCcore-11.3.0                           
   TensorFlow/2.7.1-foss-2021b-CUDA-11.4.1
   TensorFlow/2.7.1-foss-2021b-CUA-11.4.1
   TensorFlow/2.11.0-foss-2022a                        (D)
  TensorFlow/2.11.0-foss-2022a-CUA-11.7.0
   TensorFlow/2.11.0-foss-2022a                         
   Theano/1.1.2-foss-2021b-PyMC
   Theano/1.1.2-foss-2021b-PyMC
   Tk/8.6.11-GCCcore-11.2.0
   Tk/8.6.11-GCCcore-11.2.0
   Tk/8.6.12-GCCcore-11.3.0                            (D)
   Tk/8.6.12-GCCcore-11.3.0                             
   Tkinter/2.7.18-GCCcore-11.2.0
   Tkinter/2.7.18-GCCcore-11.2.0
   Tkinter/3.9.6-GCCcore-11.2.0                       (D)
  Tkinter/2.7.18-GCCcore-11.3.0
   TransDecoder/5.5.0-GCC-11.3.0
   Tkinter/3.9.6-GCCcore-11.2.0
   TransDecoder/5.7.0-GCC-11.3.0                      (D)
   Tkinter/3.10.4-GCCcore-11.3.0                     
  Transecoder/5.5.0-GCC-11.3.0
   Transecoder/5.7.0-GCC-11.3.0                       
   Transrate/1.0.3
   Transrate/1.0.3
   TreeMix/1.13-GCC-11.2.0
   TreeMix/1.13-GCC-11.2.0
Line 532: Line 595:
   Trimmomatic/0.39-Java-13
   Trimmomatic/0.39-Java-13
   Trinity/2.15.1-foss-2021b
   Trinity/2.15.1-foss-2021b
   Trinity/2.15.1-foss-2022a                          (D)
   Trinity/2.15.1-foss-2022a                           
   Trinotate/4.0.1-foss-2022a
   Trinotate/4.0.1-foss-2022a
   UCC/1.0.0-GCCcore-11.3.0
   UCC/1.0.0-GCCcore-11.3.0
   UCC/1.1.0-GCCcore-12.2.0                            (D)
   UCC/1.1.0-GCCcore-12.2.0                             
   UCLUST/1.2.22q-i86linux64
   UCLUST/1.2.22q-i86linux64
   UCX-CUDA/1.11.2-GCCcore-11.2.0-CUDA-11.4.1
   UCX-CUA/1.11.2-GCCcore-11.2.0-CUA-11.4.1
   UCX-CUDA/1.12.1-GCCcore-11.3.0-CUDA-11.7.0          (D)
   UCX-CUA/1.12.1-GCCcore-11.3.0-CUA-11.7.0           
   UCX/1.9.0-GCCcore-10.2.0
   UCX/1.9.0-GCCcore-10.2.0
   UCX/1.11.2-GCCcore-11.2.0
   UCX/1.11.2-GCCcore-11.2.0
   UCX/1.12.1-GCCcore-11.3.0
   UCX/1.12.1-GCCcore-11.3.0
   UCX/1.13.1-GCCcore-12.2.0                          (D)
   UCX/1.13.1-GCCcore-12.2.0                           
   UDUNITS/2.2.28-GCCcore-11.2.0
   UUNITS/2.2.28-GCCcore-11.2.0
   UDUNITS/2.2.28-GCCcore-11.3.0                      (D)
   UUNITS/2.2.28-GCCcore-11.3.0                       
   UMI-tools/1.1.2-foss-2021b-Python-3.9.6
   UMI-tools/1.1.2-foss-2021b-Python-3.9.6
   USEARCH/11.0.667-i86linux32
   USEARCH/11.0.667-i86linux32
   UnZip/6.0-GCCcore-11.2.0
   UnZip/6.0-GCCcore-11.2.0
   UnZip/6.0-GCCcore-11.3.0                            (D)
   UnZip/6.0-GCCcore-11.3.0                             
   Unicycler/0.5.0-gompi-2021b-Python-3.9.6
   Unicycler/0.5.0-gompi-2021b-Python-3.9.6
   Unicycler/0.5.0-gompi-2021b                        (D)
   Unicycler/0.5.0-gompi-2021b                         
   VCFtools/0.1.16-GCC-11.2.0
   VCFtools/0.1.16-GCC-11.2.0
   VEP/105-GCC-11.2.0
   VEP/105-GCC-11.2.0
Line 563: Line 626:
   WRF-Chem/4.4.2-foss-2021b-dmpar
   WRF-Chem/4.4.2-foss-2021b-dmpar
   WRF/4.3-foss-2021b-dmpar
   WRF/4.3-foss-2021b-dmpar
   WRF/4.4.2-foss-2021b-dmpar                          (D)
   WRF/4.4.2-foss-2021b-dmpar                           
   WU-Blast/2.2.6-GCC-11.2.0
   WU-Blast/2.2.6-GCC-11.2.0
  WU-Blast/2.2.6-GCC-11.3.0                         
   X11/20210802-GCCcore-11.2.0
   X11/20210802-GCCcore-11.2.0
   X11/20220504-GCCcore-11.3.0                        (D)
   X11/20220504-GCCcore-11.3.0                         
   XML-Compile/1.63-GCCcore-11.2.0
   XML-Compile/1.63-GCCcore-11.2.0
   XML-LibXML/2.0207-GCCcore-11.2.0
   XML-LibXML/2.0207-GCCcore-11.2.0
  XML-LibXML/2.0207-GCCcore-11.3.0                   
   XZ/5.2.4-GCCcore-8.3.0
   XZ/5.2.4-GCCcore-8.3.0
   XZ/5.2.5-GCCcore-10.2.0
   XZ/5.2.5-GCCcore-10.2.0
   XZ/5.2.5-GCCcore-11.2.0
   XZ/5.2.5-GCCcore-11.2.0
   XZ/5.2.5-GCCcore-11.3.0
   XZ/5.2.5-GCCcore-11.3.0
   XZ/5.2.7-GCCcore-12.2.0                            (D)
   XZ/5.2.7-GCCcore-12.2.0                             
   XlsxWriter/3.0.8-GCCcore-11.3.0
   XlsxWriter/3.0.8-GCCcore-11.3.0
   Xvfb/1.20.13-GCCcore-11.2.0
   Xvfb/1.20.13-GCCcore-11.2.0
   Xvfb/21.1.3-GCCcore-11.3.0                          (D)
   Xvfb/21.1.3-GCCcore-11.3.0                           
   Yasm/1.3.0-GCCcore-11.2.0
   Yasm/1.3.0-GCCcore-11.2.0
   Z3/4.8.12-GCCcore-11.2.0
   Z3/4.8.12-GCCcore-11.2.0
   ZeroMQ/4.3.4-GCCcore-11.2.0
   ZeroMQ/4.3.4-GCCcore-11.2.0
   Zip/3.0-GCCcore-11.2.0
   Zip/3.0-GCCcore-11.2.0
   Zip/3.0-GCCcore-11.3.0                              (D)
   Zip/3.0-GCCcore-11.3.0                               
   angsd/0.940-GCC-11.2.0
   angsd/0.940-GCC-11.2.0
   annovar/20200607-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
   annovar/20200607-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
  ant/1.10.1-Java-1.8.0_241
   ant/1.10.11-Java-11
   ant/1.10.11-Java-11
   ant/1.10.12-Java-11                                (D)
   ant/1.10.12-Java-11                                 
   archspec/0.1.3-GCCcore-11.2.0
   archspec/0.1.3-GCCcore-11.2.0
   argtable/2.13-GCCcore-11.2.0
   argtable/2.13-GCCcore-11.2.0
   aria2/1.36.0-GCCcore-11.2.0
   aria2/1.36.0-GCCcore-11.2.0
   arpack-ng/3.8.0-foss-2021b
   arpack-ng/3.8.0-foss-2021b
  arpack-ng/3.8.0-foss-2022a                         
   at-spi2-atk/2.38.0-GCCcore-11.2.0
   at-spi2-atk/2.38.0-GCCcore-11.2.0
   at-spi2-atk/2.38.0-GCCcore-11.3.0                  (D)
   at-spi2-atk/2.38.0-GCCcore-11.3.0                   
   at-spi2-core/2.40.3-GCCcore-11.2.0
   at-spi2-core/2.40.3-GCCcore-11.2.0
   at-spi2-core/2.44.1-GCCcore-11.3.0                  (D)
   at-spi2-core/2.44.1-GCCcore-11.3.0                   
   attr/2.5.1-GCCcore-11.2.0
   attr/2.5.1-GCCcore-11.2.0
   bam-readcount/0.8.0-GCC-11.2.0
   bam-readcount/0.8.0-GCC-11.2.0
Line 599: Line 666:
   bcbio-gff/0.7.0-foss-2021b
   bcbio-gff/0.7.0-foss-2021b
   bcl2fastq2/2.20.0-GCC-11.2.0
   bcl2fastq2/2.20.0-GCC-11.2.0
   beagle-lib/4.0.0-foss-2021b-CUDA-11.4.1
   beagle-lib/4.0.0-foss-2021b-CUA-11.4.1
   binutils/2.32-GCCcore-8.3.0
   binutils/2.32-GCCcore-8.3.0
   binutils/2.32
   binutils/2.32
Line 609: Line 676:
   binutils/2.38
   binutils/2.38
   binutils/2.39-GCCcore-12.2.0
   binutils/2.39-GCCcore-12.2.0
   binutils/2.39                                      (D)
   binutils/2.39                                       
   bioawk/1.0-GCC-11.2.0
   bioawk/1.0-GCC-11.2.0
   biom-format/2.1.14-foss-2021b
   biom-format/2.1.14-foss-2021b
   bokeh/2.4.2-foss-2021b
   bokeh/2.4.2-foss-2021b
   bokeh/2.4.3-foss-2021b                              (D)
   bokeh/2.4.3-foss-2021b                               
   boto3/1.20.13-GCCcore-11.2.0
   boto3/1.20.13-GCCcore-11.2.0
   breseq/0.38.1-foss-2021b
   breseq/0.38.1-foss-2021b
Line 620: Line 687:
   bzip2/1.0.8-GCCcore-8.3.0
   bzip2/1.0.8-GCCcore-8.3.0
   bzip2/1.0.8-GCCcore-11.2.0
   bzip2/1.0.8-GCCcore-11.2.0
   bzip2/1.0.8-GCCcore-11.3.0                          (D)
   bzip2/1.0.8-GCCcore-11.3.0                           
   c-ares/1.18.1-GCCcore-11.2.0
   c-ares/1.18.1-GCCcore-11.2.0
   cURL/7.78.0-GCCcore-11.2.0
   cURL/7.78.0-GCCcore-11.2.0
   cURL/7.83.0-GCCcore-11.3.0                          (D)
   cURL/7.83.0-GCCcore-11.3.0                           
   cairo/1.16.0-GCCcore-11.2.0
   cairo/1.16.0-GCCcore-11.2.0
   cairo/1.17.4-GCCcore-11.3.0                        (D)
   cairo/1.17.4-GCCcore-11.3.0                         
   canu/2.2-GCCcore-11.2.0
   canu/2.2-GCCcore-11.2.0
   ccache/4.6.3-GCCcore-11.2.0
   ccache/4.6.3-GCCcore-11.2.0
  cfour/2.1-intel-2021b-mpi
  cfour/2.1-intel-2021b-serial                       
   cppy/1.1.0-GCCcore-11.2.0
   cppy/1.1.0-GCCcore-11.2.0
   cuDNN/8.2.1.32-CUDA-11.3.1
   cppy/1.2.1-GCCcore-11.3.0                         
   cuDNN/8.2.2.26-CUDA-11.4.1
  cuNN/8.2.1.32-CUA-11.3.1
   cuDNN/8.4.1.50-CUDA-11.7.0
   cuNN/8.2.2.26-CUA-11.4.1
   cuDNN/8.8.0.121-CUDA-12.0.0                        (D)
   cuNN/8.4.1.50-CUA-11.7.0
   cuNN/8.8.0.121-CUA-12.0.0                         
   cutadapt/3.5-GCCcore-11.2.0
   cutadapt/3.5-GCCcore-11.2.0
   dask/2022.1.0-foss-2021b
   dask/2022.1.0-foss-2021b
Line 638: Line 708:
   dill/0.3.6-GCCcore-11.3.0
   dill/0.3.6-GCCcore-11.3.0
   dm-tree/0.1.6-GCCcore-11.2.0
   dm-tree/0.1.6-GCCcore-11.2.0
   dorado/0.3.0-CUDA-11.4.1
   dorado/0.3.0-CUA-11.4.1
   double-conversion/3.1.5-GCCcore-11.2.0
   double-conversion/3.1.5-GCCcore-11.2.0
   double-conversion/3.2.0-GCCcore-11.3.0              (D)
   double-conversion/3.2.0-GCCcore-11.3.0               
   eggnog-mapper/2.1.9-foss-2022a
   eggnog-mapper/2.1.9-foss-2022a
  einops/0.4.1-GCCcore-11.2.0
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   elfutils/0.185-GCCcore-11.2.0
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   expat/2.2.7-GCCcore-8.3.0
Line 647: Line 718:
   expat/2.4.1-GCCcore-11.2.0
   expat/2.4.1-GCCcore-11.2.0
   expat/2.4.8-GCCcore-11.3.0
   expat/2.4.8-GCCcore-11.3.0
   expat/2.4.9-GCCcore-12.2.0                          (D)
   expat/2.4.9-GCCcore-12.2.0                           
   expecttest/0.1.3-GCCcore-11.2.0
   expecttest/0.1.3-GCCcore-11.2.0
  fastStructure/1.0-foss-2022a-Python-2.7.18
   fastahack/1.0.0-GCCcore-11.2.0
   fastahack/1.0.0-GCCcore-11.2.0
   fastp/0.23.2-GCC-11.2.0
   fastp/0.23.2-GCC-11.2.0
   fermi-lite/20190320-GCCcore-11.2.0
   fermi-lite/20190320-GCCcore-11.2.0
   file/5.41-GCCcore-11.2.0
   file/5.41-GCCcore-11.2.0
   file/5.43-GCCcore-11.3.0                            (D)
   file/5.43-GCCcore-11.3.0                             
   filevercmp/20191210-GCCcore-11.2.0
   filevercmp/20191210-GCCcore-11.2.0
   flatbuffers-python/2.0-GCCcore-11.2.0
   flatbuffers-python/2.0-GCCcore-11.2.0
  flatbuffers-python/2.0-GCCcore-11.3.0             
   flatbuffers/2.0.0-GCCcore-11.2.0
   flatbuffers/2.0.0-GCCcore-11.2.0
   flatbuffers/2.0.7-GCCcore-11.3.0                    (D)
   flatbuffers/2.0.7-GCCcore-11.3.0                     
   flex/2.6.4-GCCcore-8.3.0
   flex/2.6.4-GCCcore-8.3.0
   flex/2.6.4-GCCcore-10.2.0
   flex/2.6.4-GCCcore-10.2.0
Line 663: Line 736:
   flex/2.6.4-GCCcore-11.3.0
   flex/2.6.4-GCCcore-11.3.0
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   flex/2.6.4-GCCcore-12.2.0
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   foss/2019b
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   foss/2021b
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   foss/2022a                                           
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   freeglut/3.2.1-GCCcore-11.2.0
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   fsom/20141119-GCCcore-11.2.0
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   gaussian/09-Intel-SSE4_2
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   help2man/1.47.16-GCCcore-10.2.0
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   intervaltree/0.1-GCCcore-11.2.0
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   intltool/0.51.0-GCCcore-11.2.0
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  jax/0.3.25-foss-2022a-CUA-11.7.0                 
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   jemalloc/5.2.1-GCCcore-11.2.0
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   jemalloc/5.2.1-GCCcore-11.3.0
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   kallisto/0.48.0-gompi-2021b
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   kim-api/2.3.0-GCCcore-11.2.0
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   kineto/0.4.0-GCC-11.2.0
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   libdrm/2.4.107-GCCcore-11.2.0
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   libgd/2.3.3-GCCcore-11.2.0
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   libunwind/1.5.0-GCCcore-11.2.0
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   libuv/1.37.0-GCCcore-11.3.0
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   libxml2/2.9.9-GCCcore-8.3.0
Line 822: Line 903:
   libxml2/2.9.10-GCCcore-11.2.0
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   libxml2/2.10.3-GCCcore-12.2.0                       
   libxslt/1.1.34-GCCcore-11.2.0
   libxslt/1.1.34-GCCcore-11.2.0
   libxslt/1.1.34-GCCcore-11.3.0                      (D)
   libxslt/1.1.34-GCCcore-11.3.0                       
   libyaml/0.2.5-GCCcore-11.2.0
   libyaml/0.2.5-GCCcore-11.2.0
   libyaml/0.2.5-GCCcore-11.3.0                        (D)
   libyaml/0.2.5-GCCcore-11.3.0                         
   lpsolve/5.5.2.11-GCC-11.2.0
   lpsolve/5.5.2.11-GCC-11.2.0
  lpsolve/5.5.2.11-GCC-11.3.0                       
   lxml/4.6.3-GCCcore-11.2.0
   lxml/4.6.3-GCCcore-11.2.0
   lz4/1.9.3-GCCcore-11.2.0
   lz4/1.9.3-GCCcore-11.2.0
   lz4/1.9.3-GCCcore-11.3.0                            (D)
   lz4/1.9.3-GCCcore-11.3.0                             
   maeparser/1.3.0-gompi-2021b
   maeparser/1.3.0-gompi-2021b
   magma/2.6.2-foss-2021b-CUDA-11.4.1
   magma/2.6.2-foss-2021b-CUA-11.4.1
   make/4.3-GCCcore-11.2.0
   make/4.3-GCCcore-11.2.0
   make/4.3-GCCcore-11.3.0                            (D)
   make/4.3-GCCcore-11.3.0                             
   makeinfo/6.7-GCCcore-8.3.0-minimal
   makeinfo/6.7-GCCcore-8.3.0-minimal
   makeinfo/6.7-GCCcore-10.2.0-minimal                (D)
   makeinfo/6.7-GCCcore-10.2.0-minimal                 
  matlab/R2022b   
  matlab/R2023a
   matplotlib/2.2.5-foss-2021b-Python-2.7.18
   matplotlib/2.2.5-foss-2021b-Python-2.7.18
  matplotlib/2.2.5-foss-2022a-Python-2.7.18
   matplotlib/3.4.3-foss-2021b
   matplotlib/3.4.3-foss-2021b
   matplotlib/3.5.2-foss-2021b                        (D)
   matplotlib/3.5.2-foss-2021b
  matplotlib/3.5.2-foss-2022a                          
   methylpy/1.4.6-foss-2021b
   methylpy/1.4.6-foss-2021b
   minimap2/2.22-GCCcore-11.2.0
   minimap2/2.22-GCCcore-11.2.0
   minimap2/2.24-GCCcore-11.2.0                        (D)
   minimap2/2.24-GCCcore-11.2.0                         
   mm-common/1.0.5-GCCcore-11.2.0
   mm-common/1.0.5-GCCcore-11.2.0
  molmod/1.4.8-foss-2021b
   motif/2.3.8-GCCcore-11.2.0
   motif/2.3.8-GCCcore-11.2.0
   multichoose/1.0.3-GCCcore-11.2.0
   multichoose/1.0.3-GCCcore-11.2.0
   ncbi-vdb/2.10.9-gompi-2021b
   ncbi-vdb/2.10.9-gompi-2021b
   ncbi-vdb/2.11.2-gompi-2021b
   ncbi-vdb/2.11.2-gompi-2021b
   ncbi-vdb/3.0.2-gompi-2022a                          (D)
   ncbi-vdb/3.0.2-gompi-2022a                           
   ncurses/6.0
   ncurses/6.0
   ncurses/6.1-GCCcore-8.3.0
   ncurses/6.1-GCCcore-8.3.0
Line 857: Line 944:
   ncurses/6.3-GCCcore-11.3.0
   ncurses/6.3-GCCcore-11.3.0
   ncurses/6.3-GCCcore-12.2.0
   ncurses/6.3-GCCcore-12.2.0
   ncurses/6.3                                        (D)
   ncurses/6.3                                         
   netCDF-Fortran/4.5.3-gompi-2021b
   netCF-Fortran/4.5.3-gompi-2021b
   netCDF/4.8.1-gompi-2021b
   netCF/4.8.1-gompi-2021b
   netCDF/4.9.0-gompi-2022a                            (D)
   netCF/4.9.0-gompi-2022a                             
  netMHCpan/4.1b
   nettle/3.7.3-GCCcore-11.2.0
   nettle/3.7.3-GCCcore-11.2.0
   nettle/3.8-GCCcore-11.3.0                          (D)
   nettle/3.8-GCCcore-11.3.0                           
   networkx/2.6.3-foss-2021b
   networkx/2.6.3-foss-2021b
   networkx/2.8.4-foss-2022a                          (D)
   networkx/2.8.4-foss-2022a                           
   nlohmann_json/3.10.5-GCCcore-11.3.0
   nlohmann_json/3.10.5-GCCcore-11.3.0
   nodejs/14.17.6-GCCcore-11.2.0
   nodejs/14.17.6-GCCcore-11.2.0
   nodejs/16.15.1-GCCcore-11.3.0                      (D)
   nodejs/16.15.1-GCCcore-11.3.0                       
   nsync/1.24.0-GCCcore-11.2.0
   nsync/1.24.0-GCCcore-11.2.0
   nsync/1.25.0-GCCcore-11.3.0                        (D)
   nsync/1.25.0-GCCcore-11.3.0                         
   numactl/2.0.12-GCCcore-8.3.0
   numactl/2.0.12-GCCcore-8.3.0
   numactl/2.0.13-GCCcore-10.2.0
   numactl/2.0.13-GCCcore-10.2.0
   numactl/2.0.14-GCCcore-11.2.0
   numactl/2.0.14-GCCcore-11.2.0
   numactl/2.0.14-GCCcore-11.3.0
   numactl/2.0.14-GCCcore-11.3.0
   numactl/2.0.16-GCCcore-12.2.0                      (D)
   numactl/2.0.16-GCCcore-12.2.0                       
   numexpr/2.8.4-foss-2021b
   numexpr/2.8.4-foss-2021b
   parallel/20221122-GCCcore-11.2.0
  pandasql/0.7.3-foss-2021b-Python-3.9.6
  parallel/20210722-GCCcore-11.2.0
   parallel/20221122-GCCcore-11.2.0                   
  pblat/2.5-GCCcore-8.3.0
   picard/2.25.1-Java-11
   picard/2.25.1-Java-11
   picard/2.27.5-Java-15                              (D)
   picard/2.27.5-Java-15                               
   pigz/2.6-GCCcore-11.2.0
   pigz/2.6-GCCcore-11.2.0
   pixman/0.40.0-GCCcore-11.2.0
   pixman/0.40.0-GCCcore-11.2.0
   pixman/0.40.0-GCCcore-11.3.0                        (D)
   pixman/0.40.0-GCCcore-11.3.0                         
   pkg-config/0.29.2-GCCcore-10.2.0
   pkg-config/0.29.2-GCCcore-10.2.0
   pkg-config/0.29.2-GCCcore-11.2.0
   pkg-config/0.29.2-GCCcore-11.2.0
   pkg-config/0.29.2-GCCcore-11.3.0                    (D)
   pkg-config/0.29.2-GCCcore-11.3.0                     
   pkgconf/1.8.0-GCCcore-11.2.0
   pkgconf/1.8.0-GCCcore-11.2.0
   pkgconf/1.8.0-GCCcore-11.3.0
   pkgconf/1.8.0-GCCcore-11.3.0
   pkgconf/1.8.0
   pkgconf/1.8.0
   pkgconf/1.9.3-GCCcore-12.2.0                        (D)
   pkgconf/1.9.3-GCCcore-12.2.0                         
   pkgconfig/1.5.5-GCCcore-11.2.0-python
   pkgconfig/1.5.5-GCCcore-11.2.0-python
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   pkgconfig/1.5.5-GCCcore-11.3.0-python               
   plotly.py/5.4.0-GCCcore-11.2.0
   plotly.py/5.4.0-GCCcore-11.2.0
   poppler/22.11.0-GCC-11.2.0
   poppler/22.11.0-GCC-11.2.0
Line 896: Line 987:
   pretty-yaml/21.10.1-GCCcore-11.2.0
   pretty-yaml/21.10.1-GCCcore-11.2.0
   prodigal/2.6.3-GCCcore-11.2.0
   prodigal/2.6.3-GCCcore-11.2.0
   prodigal/2.6.3-GCCcore-11.3.0                      (D)
   prodigal/2.6.3-GCCcore-11.3.0                       
   protobuf-python/3.17.3-GCCcore-11.2.0
   protobuf-python/3.17.3-GCCcore-11.2.0
   protobuf-python/3.19.4-GCCcore-11.3.0              (D)
   protobuf-python/3.19.4-GCCcore-11.3.0               
   protobuf/3.17.3-GCCcore-11.2.0
   protobuf/3.17.3-GCCcore-11.2.0
   protobuf/3.19.4-GCCcore-11.3.0                      (D)
   protobuf/3.19.4-GCCcore-11.3.0                       
  psutil/5.9.4-GCCcore-11.2.0
   purge_dups/1.2.5-foss-2021b
   purge_dups/1.2.5-foss-2021b
   pyBigWig/0.3.18-foss-2021b
   pyBigWig/0.3.18-foss-2021b
Line 906: Line 998:
   pybind11/2.7.1-GCCcore-11.2.0-Python-2.7.18
   pybind11/2.7.1-GCCcore-11.2.0-Python-2.7.18
   pybind11/2.7.1-GCCcore-11.2.0
   pybind11/2.7.1-GCCcore-11.2.0
   pybind11/2.9.2-GCCcore-11.3.0                      (D)
  pybind11/2.7.1-GCCcore-11.3.0-Python-2.7.18
   pybind11/2.9.2-GCCcore-11.3.0                       
   pytest-xdist/2.5.0-GCCcore-11.2.0
   pytest-xdist/2.5.0-GCCcore-11.2.0
  pytest-xdist/2.5.0-GCCcore-11.3.0                 
  pytest/7.1.3-GCCcore-11.2.0
   python-isal/0.11.1-GCCcore-11.2.0
   python-isal/0.11.1-GCCcore-11.2.0
   python-isal/1.1.0-GCCcore-11.2.0                    (D)
   python-isal/1.1.0-GCCcore-11.2.0                     
   re2c/2.2-GCCcore-11.2.0
   re2c/2.2-GCCcore-11.2.0
  rjags/4-12-foss-2021b-R-4.2.1
   scikit-bio/0.5.7-foss-2021b
   scikit-bio/0.5.7-foss-2021b
   scikit-build/0.11.1-GCCcore-11.2.0
   scikit-build/0.11.1-GCCcore-11.2.0
   scikit-image/0.19.1-foss-2021b
   scikit-image/0.19.1-foss-2021b
   scikit-learn/1.0.1-foss-2021b
   scikit-learn/1.0.1-foss-2021b
  scikit-learn/1.1.2-foss-2022a                     
   scikit-optimize/0.9.0-foss-2021b
   scikit-optimize/0.9.0-foss-2021b
   seqtk/1.3-GCC-11.2.0
   seqtk/1.3-GCC-11.2.0
   smithwaterman/20160702-GCCcore-11.2.0
   smithwaterman/20160702-GCCcore-11.2.0
   snappy/1.1.9-GCCcore-11.2.0
   snappy/1.1.9-GCCcore-11.2.0
   snappy/1.1.9-GCCcore-11.3.0                        (D)
   snappy/1.1.9-GCCcore-11.3.0                         
   spaln/2.4.12-GCC-11.2.0
   spaln/2.4.12-GCC-11.2.0
   sparsehash/2.0.4-GCCcore-11.2.0
   sparsehash/2.0.4-GCCcore-11.2.0
Line 925: Line 1,022:
   statsmodels/0.13.1-foss-2021b
   statsmodels/0.13.1-foss-2021b
   tRNAscan-SE/2.0.12-foss-2021b
   tRNAscan-SE/2.0.12-foss-2021b
   tRNAscan-SE/2.0.12-GCC-11.2.0                      (D)
   tRNAscan-SE/2.0.12-GCC-11.2.0                       
   tabixpp/1.1.0-GCC-11.2.0
   tabixpp/1.1.0-GCC-11.2.0
  tbb/2019_U9-GCCcore-8.3.0
   tbb/2020.3-GCCcore-11.2.0
   tbb/2020.3-GCCcore-11.2.0
   tbb/2021.5.0-GCCcore-11.3.0                        (D)
   tbb/2021.5.0-GCCcore-11.3.0                         
   tcsh/6.24.01-GCCcore-11.2.0
   tcsh/6.24.01-GCCcore-11.2.0
  tensorboard/2.8.0-foss-2021b
   time/1.9-GCCcore-11.2.0
   time/1.9-GCCcore-11.2.0
  tmux/3.3a-GCCcore-11.3.0
   tqdm/4.62.3-GCCcore-11.2.0
   tqdm/4.62.3-GCCcore-11.2.0
   typing-extensions/3.10.0.2-GCCcore-11.2.0
   typing-extensions/3.10.0.2-GCCcore-11.2.0
   ucsc/434
   ucsc/434
   ucsc/443                                            (D)
   ucsc/443                                             
   utf8proc/2.6.1-GCCcore-11.2.0
   utf8proc/2.6.1-GCCcore-11.2.0
  utf8proc/2.7.0-GCCcore-11.3.0                     
   util-linux/2.37-GCCcore-11.2.0
   util-linux/2.37-GCCcore-11.2.0
   util-linux/2.38-GCCcore-11.3.0                      (D)
   util-linux/2.38-GCCcore-11.3.0                       
  vcflib/1.0.3-foss-2021b-R-4.1.2
   wget/1.21.3-GCCcore-11.3.0
   wget/1.21.3-GCCcore-11.3.0
   x264/20210613-GCCcore-11.2.0
   x264/20210613-GCCcore-11.2.0
Line 945: Line 1,047:
   xorg-macros/1.19.3-GCCcore-11.2.0
   xorg-macros/1.19.3-GCCcore-11.2.0
   xorg-macros/1.19.3-GCCcore-11.3.0
   xorg-macros/1.19.3-GCCcore-11.3.0
   xorg-macros/1.19.3-GCCcore-12.2.0                  (D)
   xorg-macros/1.19.3-GCCcore-12.2.0                   
   xprop/1.2.5-GCCcore-11.2.0
   xprop/1.2.5-GCCcore-11.2.0
   xxd/8.2.4220-GCCcore-11.2.0
   xxd/8.2.4220-GCCcore-11.2.0
  yaff/1.6.0-foss-2021b
   zlib/1.2.11-GCCcore-8.3.0
   zlib/1.2.11-GCCcore-8.3.0
   zlib/1.2.11-GCCcore-10.2.0
   zlib/1.2.11-GCCcore-10.2.0
Line 954: Line 1,057:
   zlib/1.2.12-GCCcore-11.3.0
   zlib/1.2.12-GCCcore-11.3.0
   zlib/1.2.12-GCCcore-12.2.0
   zlib/1.2.12-GCCcore-12.2.0
   zlib/1.2.12                                        (D)
   zlib/1.2.12                                         
   zstd/1.5.0-GCCcore-11.2.0
   zstd/1.5.0-GCCcore-11.2.0
   zstd/1.5.2-GCCcore-11.3.0                           (D)
   zstd/1.5.2-GCCcore-11.3.0

Latest revision as of 14:32, 4 August 2023

As part of our August 29-31,2023 maintenance window, the GACRC will be upgrading the Sapelo2 cluster operating system from CentOS 7 to Rocky 8.

Because this is a major OS update, we need to recompile all the applications and ensure that they work with the new version of OS.

Below is a list of the modules already installed on the Rocky 8 system. More software packages continue to be installed. If the software you need is not in this list yet, please feel free to let us know, if you would like us to install it centrally on the updated cluster.

All singularity containers available in /apps/singularity-images on the current Sapelo2 (CentOS 7) will continue to be available after the maintenance.


List of software already installed centrally on the Rocky 8 system (new Sapelo2, available after the maintenance)

  3-NA/201008-foss-2021b-Python-2.7.18
  ABySS/2.3.5-foss-2021b
  ACTC/1.1-GCCcore-11.2.0
  AMIXTURE/1.3.0
  AGAT/0.9.2-GCC-11.2.0
  AGAT/1.1.0                                          
  AMOS/3.1.0-foss-2021b
  ANTLR/2.7.7-GCCcore-11.2.0-Java-11
  ANTs/2.4.4-foss-2021b
  APR-util/1.6.1-GCCcore-11.2.0
  APR/1.7.0-GCCcore-11.2.0
  ART/2016.06.05-GCC-11.2.0
  ASE/3.22.1-foss-2021b
  ASTRAL/5.7.8-Java-1.8.0_241
  ATK/2.36.0-GCCcore-11.2.0
  ATK/2.38.0-GCCcore-11.3.0                           
  AUGUSTUS/3.4.0-foss-2021b
  AUGUSTUS/3.5.0-foss-2022a                           
  AlignGraph/2023-03-02-GCC-8.3.0
  AlphaFold/2.3.4-foss-2022a-CUA-11.7.0-ColabFold
  Amber/22.0-foss-2021b-AmberTools-22.3-CUA-11.4.1
  Anaconda3/2022.10
  Archive-Zip/1.68-GCCcore-11.2.0
  Armadillo/11.4.3-foss-2021b
  Armadillo/11.4.3-foss-2022a                         
  Arrow/8.0.0-foss-2021b
  Autoconf/2.69-GCCcore-8.3.0
  Autoconf/2.69-GCCcore-10.2.0
  Autoconf/2.71-GCCcore-11.2.0
  Autoconf/2.71-GCCcore-11.3.0
  Autoconf/2.71-GCCcore-12.2.0                        
  Automake/1.16.1-GCCcore-8.3.0
  Automake/1.16.2-GCCcore-10.2.0
  Automake/1.16.4-GCCcore-11.2.0
  Automake/1.16.5-GCCcore-11.3.0
  Automake/1.16.5-GCCcore-12.2.0                      
  Autotools/20180311-GCCcore-8.3.0
  Autotools/20200321-GCCcore-10.2.0
  Autotools/20210726-GCCcore-11.2.0
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  Bottleneck/1.3.7-foss-2022a
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  Bowtie/1.3.1-GCC-11.3.0                             
  Bowtie2/2.4.1-GCC-8.3.0
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  Bowtie2/2.4.5-GCC-11.3.0                            
  Bracken/2.7-GCCcore-11.2.0
  Brotli/1.0.9-GCCcore-11.2.0
  Brotli/1.0.9-GCCcore-11.3.0                         
  C-HIT/4.8.1-GCC-11.2.0
  C-HIT/4.8.1-GCC-11.3.0                             
  CFITSIO/3.49-GCCcore-11.2.0
  CGAL/4.14.3-gompi-2021b
  CGmapTools/0.1.2-foss-2021b
  CMake/3.12.1
  CMake/3.21.1-GCCcore-11.2.0
  CMake/3.22.1-GCCcore-11.2.0
  CMake/3.23.1-GCCcore-11.3.0
  CMake/3.24.3-GCCcore-11.3.0                         
  CUA/11.3.1
  CUA/11.4.1
  CUA/11.7.0
  CUA/12.0.0                                         
  CapnProto/0.9.1-GCCcore-11.2.0
  CellRanger/7.0.0
  Centrifuge/1.0.4-gompi-2021b
  Cereal/1.3.0
  CheMPS2/1.8.11-foss-2021b
  Check/0.15.2-GCCcore-11.2.0
  CheckM/1.1.3-foss-2021b
  Chimera/1.16-linux_x86_64
  Circos/0.69-9-GCCcore-11.2.0
  Clang/13.0.1-GCCcore-11.2.0
  Clustal-Omega/1.2.4-GCC-11.2.0
  ClustalW2/2.1-GCC-11.2.0
  Consed/29.0-foss-2021b
  Consed/29.0-foss-2022a                              
  CoordgenLibs/3.0.1-gompi-2021b
  CppUnit/1.15.1-GCCcore-11.2.0
  Cufflinks/20190706-GCC-11.2.0
  Cython/0.27.3-GCCcore-11.3.0-Python-2.7.18
  Cytoscape/3.9.1-Java-11
  B/18.1.32-GCCcore-8.3.0
  B/18.1.40-GCCcore-10.2.0
  B/18.1.40-GCCcore-11.2.0
  B/18.1.40-GCCcore-11.3.0
  B/18.1.40-GCCcore-12.2.0                           
  B-mysql/4.050-GCC-11.2.0
  B_File/1.857-GCCcore-11.2.0
  B_File/1.858-GCCcore-11.3.0                        
  Bus/1.13.18-GCCcore-11.2.0
  Bus/1.14.0-GCCcore-11.3.0                          
  IAMON/2.0.13-GCC-11.2.0
  IAMON/2.0.15-GCC-11.2.0
  IAMON/2.1.0-GCC-11.3.0                            
  ataWarrior/5.5.0
  endroPy/4.5.2-GCCcore-11.2.0
  eve-Size/0.83-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
  ockQ/1.0-foss-2022a
  oxygen/1.9.1-GCCcore-11.2.0
  oxygen/1.9.4-GCCcore-11.3.0                        
  ELPA/2021.11.001-foss-2021b
  EMBOSS/6.6.0-foss-2021b
  ETE/3.1.2-foss-2021b
  EasyBuild/4.6.0
  Eigen/3.3.9-GCCcore-11.2.0
  Eigen/3.4.0-GCCcore-11.2.0
  Eigen/3.4.0-GCCcore-11.3.0                          
  EnTAP/0.10.8-beta-foss-2021b
  Exonerate/2.4.0-GCC-11.2.0
  Exonerate/2.4.0-GCC-11.3.0                          
  FASTX-Toolkit/0.0.14-GCC-11.2.0
  FFTW.MPI/3.3.10-gompi-2022a
  FFTW/3.3.8-gompi-2019b
  FFTW/3.3.10-GCC-11.3.0
  FFTW/3.3.10-gompi-2021b                             
  FFmpeg/4.3.2-GCCcore-11.2.0
  FLAC/1.3.3-GCCcore-11.2.0
  FLAC/1.3.4-GCCcore-11.3.0                           
  FLASH/2.2.00-GCC-11.2.0
  FLTK/1.3.7-GCCcore-11.2.0
  FSL/6.0.5.1-foss-2021b
  FTGL/2.4.0-GCCcore-11.3.0
  FastANI/1.33-GCC-11.2.0
  FastME/2.1.6.1-GCC-11.2.0
  FastQC/0.11.9-Java-11
  FastTree/2.1.11-GCCcore-11.2.0
  Flask/2.0.2-GCCcore-11.2.0
  Flask/2.2.2-GCCcore-11.3.0                          
  FlexiBLAS/3.0.4-GCC-11.2.0
  FlexiBLAS/3.2.0-GCC-11.3.0                          
  Flye/2.9.1-GCC-11.2.0
  FragGeneScan/1.31-GCCcore-11.2.0
  FreeImage/3.18.0-GCCcore-11.2.0
  FreeSurfer/7.4.1-foss-2021b
  FriBidi/1.0.10-GCCcore-11.2.0
  FriBidi/1.0.12-GCCcore-11.3.0                       
  GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.2.0-Java-11
  GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.2.0-Java-13.0.2
  GATK/4.3.0.0-GCCcore-11.3.0-Java-11                 
  GCC/8.3.0
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  GCC/11.2.0
  GCC/11.3.0
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  GCCcore/8.3.0
  GCCcore/10.2.0
  GCCcore/11.2.0
  GCCcore/11.3.0
  GCCcore/12.2.0                                      
  G/2.75-GCCcore-11.2.0
  GAL/3.3.2-foss-2021b
  GAL/3.5.0-foss-2022a                               
  GRCopy/2.3-GCCcore-11.2.0
  GRCopy/2.3-GCCcore-11.3.0                          
  GEM/1.5.1-foss-2022a
  GEOS/3.9.1-GCC-11.2.0
  GEOS/3.10.3-GCC-11.3.0                              
  GLPK/5.0-GCCcore-11.2.0
  GLPK/5.0-GCCcore-11.3.0                             
  GLib/2.69.1-GCCcore-11.2.0
  GLib/2.72.1-GCCcore-11.3.0                          
  GLibmm/2.66.4-GCCcore-11.2.0
  GMAP-GSNAP/2021-21-17-GCC-11.2.0
  GMAP-GSNAP/2023-02-17-GCC-11.3.0                    
  GMP/6.1.2-GCCcore-8.3.0
  GMP/6.2.1-GCCcore-11.2.0
  GMP/6.2.1-GCCcore-11.3.0                            
  GObject-Introspection/1.68.0-GCCcore-11.2.0
  GObject-Introspection/1.72.0-GCCcore-11.3.0         
  GROMACS/2021.5-foss-2021b-CUA-11.4.1-PLUME-2.8.0
  GSL/2.7-GCC-11.2.0
  GSL/2.7-GCC-11.3.0                                  
  GST-plugins-base/1.18.5-GCC-11.2.0
  GStreamer/1.18.5-GCC-11.2.0
  GTK+/3.24.23-GCCcore-11.3.0
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  GTS/0.7.6-GCCcore-11.2.0
  Gdk-Pixbuf/2.42.6-GCCcore-11.2.0
  Gdk-Pixbuf/2.42.8-GCCcore-11.3.0                    
  GeneMark-ET/4.71-GCCcore-11.2.0
  GeneMark-ET/4.71-GCCcore-11.3.0                     
  GeneMarkS-T/5.1-GCCcore-11.2.0
  Genome/05012020-foss-2021b
  Genome/05012020-foss-2022a                          
  GenomeThreader/1.7.3-Linux_x86_64-64bit
  GenomeTools/1.6.2-GCC-11.2.0
  GffCompare/0.12.6-GCC-11.2.0
  Ghostscript/9.54.0-GCCcore-11.2.0
  Ghostscript/9.56.1-GCCcore-11.3.0                   
  GitPython/3.1.24-GCCcore-11.2.0
  GlimmerHMM/3.0.4c-GCC-11.2.0
  Globus-CLI/3.6.0-GCCcore-11.2.0
  Go/1.17.6
  Grace/5.1.25-foss-2021b
  Graphviz/2.50.0-GCCcore-11.2.0
  Guile/1.8.8-GCCcore-8.3.0
  Guile/3.0.7-GCCcore-11.2.0                          
  HF/4.2.15-GCCcore-11.2.0
  HF/4.2.15-GCCcore-11.3.0                           
  HF5/1.10.8-gompi-2021b
  HF5/1.10.8-gompi-2022a
  HF5/1.12.1-gompi-2021b
  HF5/1.12.2-gompi-2022a                             
  HEC-RAS/6.10
  HH-suite/3.3.0-gompi-2021b
  HH-suite/3.3.0-gompi-2022a                          
  HISAT2/2.2.1-gompi-2021b
  HISAT2/2.2.1-gompi-2022a                            
  HMMER/3.3.2-gompi-2021b
  HMMER/3.3.2-gompi-2022a                             
  HPL/2.3-foss-2021b
  HTSeq/2.0.2-foss-2021b
  HTSlib/1.9-GCC-11.2.0
  HTSlib/1.14-GCC-11.2.0
  HTSlib/1.15.1-GCC-11.3.0                            
  HarfBuzz/2.8.2-GCCcore-11.2.0
  HarfBuzz/4.2.1-GCCcore-11.3.0                       
  Homer/4.11-foss-2021b
  HyPhy/2.5.33-gompi-2021b
  HybPiper/2.1.6-conda
  ICU/69.1-GCCcore-11.2.0
  ICU/71.1-GCCcore-11.3.0                             
  IBA-U/1.1.3-GCC-11.2.0
  IGV/2.16.1-Java-11
  IPython/7.26.0-GCCcore-11.2.0
  IQ-TREE/2.2.1-gompi-2021b
  ISA-L/2.30.0-GCCcore-11.2.0
  ImageMagick/7.1.0-4-GCCcore-11.2.0
  ImageMagick/7.1.0-37-GCCcore-11.3.0                 
  Infernal/1.1.4-foss-2021b
  Infernal/1.1.4-foss-2022a                           
  InterProScan/5.62-94.0-foss-2021b
  JAGS/4.3.0-foss-2021b
  JUnit/4.12-Java-1.8.0_241
  JasPer/2.0.33-GCCcore-11.2.0
  JasPer/2.0.33-GCCcore-11.3.0                        
  Java/1.7.0_80
  Java/1.8.0_241
  Java/11.0.16                                        
  Java/13.0.2                                        
  Java/15.0.1                                        
  Java/17.0.6                                        
  Jellyfish/2.3.0-GCC-11.2.0
  Jellyfish/2.3.0-GCC-11.3.0                          
  JsonCpp/1.9.4-GCCcore-11.2.0
  JsonCpp/1.9.5-GCCcore-11.3.0                        
  Judy/1.0.5-GCCcore-11.2.0
  Judy/1.0.5-GCCcore-11.3.0                           
  Julia/1.8.2-linux-x86_64
  Kalign/3.3.2-GCCcore-11.2.0
  Kalign/3.3.5-GCCcore-11.3.0                         
  Kent_tools/422-GCC-11.2.0
  KerasTuner/1.3.5-foss-2022a
  KronaTools/2.8.1-GCCcore-11.2.0
  LAME/3.100-GCCcore-11.2.0
  LAME/3.100-GCCcore-11.3.0                           
  LAMMPS/23Jun2022-foss-2021b-kokkos
  LAPACK/3.10.1-GCC-11.2.0
  LASTZ/1.04.15-foss-2021b
  LLVM/12.0.1-GCCcore-11.2.0
  LLVM/14.0.3-GCCcore-11.3.0                          
  LMB/0.9.29-GCCcore-11.2.0
  LMB/0.9.29-GCCcore-11.3.0                          
  LS2/2.3-GCCcore-11.2.0
  LTR_retriever/2.9.0-foss-2021b-RepeatMasker-4.1.4
  LTR_retriever/2.9.0-foss-2021b                      
  LZO/2.10-GCCcore-11.2.0
  LZO/2.10-GCCcore-11.3.0                             
  LibTIFF/4.3.0-GCCcore-11.2.0
  LibTIFF/4.3.0-GCCcore-11.3.0                        
  LightGBM/3.3.5-foss-2021b-CUA-11.4.1
  LightGBM/3.3.5-foss-2021b                           
  LittleCMS/2.12-GCCcore-11.2.0
  LittleCMS/2.13.1-GCCcore-11.3.0                     
  LoFreq/2.1.3.1-foss-2021b-Python-2.7.18
  Lua/5.4.3-GCCcore-11.2.0
  M4/1.4.18-GCCcore-8.3.0
  M4/1.4.18-GCCcore-10.2.0
  M4/1.4.18
  M4/1.4.19-GCCcore-11.2.0
  M4/1.4.19-GCCcore-11.3.0
  M4/1.4.19-GCCcore-12.2.0
  M4/1.4.19                                           
  MACS2/2.2.7.1-foss-2021b
  MAFFT/7.490-GCC-11.2.0-with-extensions
  MAFFT/7.490-gompi-2021b-with-extensions             
  MAKER/3.01.04-foss-2022a
  MCL/14.137-GCCcore-11.2.0
  MEGAN/6.24.23-Java-17
  MEME/5.4.1-gompi-2021b
  MEME/5.5.0-gompi-2021b                              
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  METIS/5.1.0-GCCcore-11.3.0                          
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  MMseqs2/14-7e284-gompi-2021b
  MMseqs2/14-7e284-gompi-2022a                        
  MPACK/3.0.0-foss-2021b
  MPFR/4.1.0-GCCcore-11.2.0
  MPFR/4.1.0-GCCcore-11.3.0                           
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  MUMmer/4.0.0rc1-GCCcore-11.2.0                      
  MUSCLE/3.8.31-GCCcore-11.2.0
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  Mako/1.1.4-GCCcore-11.2.0
  Mako/1.2.0-GCCcore-11.3.0                           
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  Miniconda3/4.12.0
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  RepeatProfiler/1.1-foss-2021b
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  Rosetta/2022.46.334-intel-2021b
  Ruby/3.0.5-GCCcore-11.2.0
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  SAMtools/0.1.20-GCC-11.2.0
  SAMtools/1.6-GCC-11.2.0
  SAMtools/1.14-GCC-11.2.0
  SAMtools/1.16.1-GCC-11.3.0                          
  SCons/4.2.0-GCCcore-11.2.0
  SEPP/4.5.1-foss-2021b
  SLATEC/4.1-GCC-11.2.0
  SMRT-Link/12.0.0.177059-cli-tools-only
  SNAP-HMM/20190603-GCC-11.2.0
  SNAP-HMM/20221022-GCC-11.3.0                        
  SNAP/2.0.1-GCC-11.2.0
  SNPGenie/1.0-foss-2021b-Perl-5.34.0
  SPAdes/3.15.3-GCC-11.2.0
  SPAdes/3.15.5-GCC-11.2.0-kmer300
  SPAdes/3.15.5-GCC-11.2.0                            
  SQANTI3/5.1.1
  SQLAlchemy/1.4.42-foss-2021b-Python-3.9.6
  SQLite/3.29.0-GCCcore-8.3.0
  SQLite/3.36-GCCcore-11.2.0
  SQLite/3.38.3-GCCcore-11.3.0                        
  SRA-Toolkit/3.0.1-centos_linux64
  SRA-Toolkit/3.0.3-gompi-2022a                       
  SSW/1.1-GCCcore-11.2.0
  STAR/2.7.10b-GCC-11.2.0
  STAR/2.7.10b-GCC-11.3.0                             
  SWIG/4.0.2-GCCcore-11.2.0
  SWIG/4.0.2-GCCcore-11.3.0                           
  Salmon/0.8.2
  Salmon/1.9.0-GCC-11.2.0
  Salmon/1.9.0-GCC-11.3.0                             
  ScaFaCoS/1.0.1-foss-2021b
  ScaLAPACK/2.0.2-gompi-2019b
  ScaLAPACK/2.1.0-gompi-2021b-fb
  ScaLAPACK/2.2.0-gompi-2022a-fb                      
  SciPy-bundle/2021.10-foss-2021b-Python-2.7.18
  SciPy-bundle/2021.10-foss-2021b
  SciPy-bundle/2021.10-foss-2022a-Python-2.7.18
  SciPy-bundle/2022.05-foss-2021b
  SciPy-bundle/2022.05-foss-2022a                     
  SeqKit/0.16.1
  SeqKit/2.3.1                                        
  SeqLib/1.2.0-GCC-11.2.0
  Serf/1.3.9-GCCcore-11.2.0
  Shapely/1.8.2-foss-2021b
  ShortStack/4.0.1-foss-2021b-Perl-5.34.0
  SignalP/4.1f-GCCcore-11.2.0
  SignalP/5.0b-Linux
  SignalP/6.0g-GCCcore-11.2.0-slow-sequential         
  Stacks/2.62-foss-2021b
  StringTie/2.2.1-GCC-11.2.0
  Structure/2.3.4-GCC-11.2.0
  Subread/2.0.3-GCC-11.2.0
  Subversion/1.14.1-GCCcore-11.2.0
  SuiteSparse/5.10.1-foss-2021b-METIS-5.1.0
  SuiteSparse/5.13.0-foss-2022a-METIS-5.1.0           
  Szip/2.1.1-GCCcore-11.2.0
  Szip/2.1.1-GCCcore-11.3.0                           
  TASSEL/5.2.44-Java-1.8.0_241
  TMHMM/2.0c-GCCcore-11.2.0-Perl-5.34.0
  TRF/4.09.1-GCCcore-11.2.0
  TRF/4.09.1-GCCcore-11.3.0                           
  TWL-NINJA/0.97-cluster_only-GCC-11.2.0
  TWL-NINJA/0.98-cluster_only-GCC-11.2.0              
  Tcl/8.6.9-GCCcore-8.3.0
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  Tcl/8.6.12-GCCcore-11.3.0                           
  TensorFlow/2.7.1-foss-2021b-CUA-11.4.1
  TensorFlow/2.11.0-foss-2022a-CUA-11.7.0
  TensorFlow/2.11.0-foss-2022a                        
  Theano/1.1.2-foss-2021b-PyMC
  Tk/8.6.11-GCCcore-11.2.0
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  Tkinter/2.7.18-GCCcore-11.3.0
  Tkinter/3.9.6-GCCcore-11.2.0
  Tkinter/3.10.4-GCCcore-11.3.0                       
  Transecoder/5.5.0-GCC-11.3.0
  Transecoder/5.7.0-GCC-11.3.0                       
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  Trinotate/4.0.1-foss-2022a
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  UCLUST/1.2.22q-i86linux64
  UCX-CUA/1.11.2-GCCcore-11.2.0-CUA-11.4.1
  UCX-CUA/1.12.1-GCCcore-11.3.0-CUA-11.7.0          
  UCX/1.9.0-GCCcore-10.2.0
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  UMI-tools/1.1.2-foss-2021b-Python-3.9.6
  USEARCH/11.0.667-i86linux32
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  Unicycler/0.5.0-gompi-2021b-Python-3.9.6
  Unicycler/0.5.0-gompi-2021b                         
  VCFtools/0.1.16-GCC-11.2.0
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  VSEARCH/2.22.1-GCC-11.2.0
  VTK/9.1.0-foss-2021b
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  WEKA/3.8.6-Java-1.8.0_241
  WPS/4.4-foss-2021b-dmpar
  WRF-Chem-KPP/4.4.2-foss-2021b-dmpar
  WRF-Chem/4.4.2-foss-2021b-dmpar
  WRF/4.3-foss-2021b-dmpar
  WRF/4.4.2-foss-2021b-dmpar                          
  WU-Blast/2.2.6-GCC-11.2.0
  WU-Blast/2.2.6-GCC-11.3.0                           
  X11/20210802-GCCcore-11.2.0
  X11/20220504-GCCcore-11.3.0                         
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  XML-LibXML/2.0207-GCCcore-11.3.0                    
  XZ/5.2.4-GCCcore-8.3.0
  XZ/5.2.5-GCCcore-10.2.0
  XZ/5.2.5-GCCcore-11.2.0
  XZ/5.2.5-GCCcore-11.3.0
  XZ/5.2.7-GCCcore-12.2.0                             
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