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Revision as of 09:58, 27 August 2020

Below is a partial list of software packages installed on Sapelo2, Teaching (we are in the process of adding wiki pages for more applications). To view a list of all modules installed on Sapelo2/Teaching, along with a short description, please run the following command on Sapelo2/Teaching:

module spider

You can also use the command above to search for a specific application. For more information, please see Lmod.

Note: Although we have not made individual software pages for the applications installed on on the Slurm test cluster (Sap2test), there are currently over 550 software packages installed there. For information on software installed there, please see Software on sap2test.

Installed Software List

Last updated 2020-08-27. Note: Click on the icons to the right of the column headings to sort the table. 0-9 A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z

Name	Version	Category	Cluster
3D-DNA	180922	Bioinformatics	Sapelo2
3SEQ	1.7	Bioinformatics	Sapelo2
4p	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
ABySS	1.9.0, 2.0.2, 2.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
ADMIXTURE	1.3.0	Bioinformatics	Sapelo2
aeneas	1.7.3	Other	Sapelo2
AFNI	17.3.05	Other	Sapelo2
AGAT	0.4.0	Bioinformatics	Sapelo2
AGEnt	0.3.1	Bioinformatics	Sapelo2
AIM-HII	0.5.5	Bioinformatics	Sapelo2
Albacore	2.3.4-cp35	Bioinformatics	Sapelo2
AlignGraph	20180709	Bioinformatics	Sapelo2
AlleleSeq_pipeline	1.2a	Bioinformatics	Sapelo2
ALLHiC	0.8.11	Bioinformatics	Sapelo2
Allim	1.2	Bioinformatics	Sapelo2
ALLMAPS	20190208	Bioinformatics	Sapelo2
AMBER	14, 16, 18	Chemistry	Sapelo2
AMOS	3.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
Anaconda2	5.0.1, 2018.12, 2019.03	Programming	Sapelo2
Anaconda3	5.0.1, 2018.12, 2019.03	Programming	Sapelo2
ANGEL	2.5	Bioinformatics	Sapelo2
annovar	2017Jul16	Bioinformatics	sapelo2
ANSYS	18.2, 19.2	Engineering	Sapelo2
antiSMASH	4.2.0, 5.0.0	Bioinformatics	sapelo2
anvi'o	4, 5.1, 5.3, 5.4, 6.1	Bioinformatics	sapelo2
Apollo	1.1	Bioinformatics	sapelo2
Aragorn	1.2.38	Bioinformatics	Sapelo2
Arlequin	3.5.2.2	Bioinformatics	Sapelo2
ART	20160605	Bioinformatics	Sapelo2
ARCS	1.0.5	Bioinformatics	Sapelo2
Artemis	17.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
ASTRAL	5.6.1	Bioinformatics	Sapelo2
ATk	2.22.0	Other	Sapelo2
ATLAS	3.10.2	Other	Sapelo2
AUGUSTUS	3.2.3, 3.3.2	Bioinformatics	Sapelo2
AutoVOT	0.93	Other	Sapelo2
bam2fastx	1.3.0	Bioinformatics	Sapelo2
BamTools	2.4.1, 2.5.1	Bioinformatics	Sapelo2
Barrnap	0.9	Bioinformatics	Sapelo2
basespace-cli	0.9.17	Bioinformatics	Sapelo2
Basset	20200107	Bioinformatics	Sapelo2
BayesAss	3.0.4	Bioinformatics	Sapelo2
BayeScan	2.1	Bioinformatics	Sapelo2
bax2bam	0.0.9	Bioinformatics	Sapelo2
Bazel	0.8.1, 0.11.1	Other	Sapelo2
BBMap	37.67, 38.73	Bioinformatics	Sapelo2
BCFtools	1.1, 1.3.1, 1.6, 1.8, 1.9	Bioinformatics	Sapelo2
bcgTree	1.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
bcl2fastq	2.20.0	Bioinformatics	Sapelo2
Beast	1.8.4, 1.10.1, 1.10.3, 1.10.4, 2.4.8pre, 2.4.8, 2.5.0, 2.5.1	Bioinformatics	Sapelo2
BEDOPS	2.4.30	Bioinformatics	Sapelo2
BEDTools	2.17.0, 2.26.0, 2.28.0, 2.29.2	Bioinformatics	Sapelo2
BerkeleyGW	2.1	Physics	Sapelo2
bioawk	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
BioKanga	21.0.0	Bioinformatics	Sapelo2
Biom-format	2.1.7	Bioinformatics	Sapelo2
BionanoSolve	3.2.1-04122018, 3.2.2-08222018 3.3-10252018, 3.4-06042019	Bioinformatics	Sapelo2
BioPerl	1.7.1	Bioinformatics	Sapelo2
BioPython	1.68	Bioinformatics	Sapelo2
Biopython	1.75	Bioinformatics	Teaching
Bismark	0.20.0, 0.22.1, 0.22.3	Bioinformatics	Sapelo2
Bison	2.7, 3.0.2, 3.0.4	Other	Sapelo2
BLASR	2.2	Bioinformatics	Sapelo2
BLAST+	2.2.31, 2.6.0, 2.7.1, 2.9.0, 2.10.0	Bioinformatics	Sapelo2
BLAST+	2.9.0	Bioinformatics	Teaching
BLAST	2.2.26	Bioinformatics	Sapelo2
BLAST	2.2.26	Bioinformatics	Teaching
BLAT	3.4, 3.5	Bioinformatics	Sapelo2
BlobTools	1.1.1	Bioinformatics	Sapelo2
Blosc	1.12.1	Library	Sapelo2
BOLT-LMM	2.3.4	Bioinformatics	Sapelo2
Boost	1.54.0, 1.61.0, 1.63.0, 1.65.1	Library	Sapelo2
Boto3	1.9.14	Other	Sapelo2
bowtie2	2.2.3, 2.3.3, 2.3.4.1, 2.3.4.2, 2.3.5.1	Bioinformatics	Sapelo2
Bowtie2	2.3.5.1, 2.4.1	Bioinformatics	Teaching
Bowtie	1.2.2	Bioinformatics	Sapelo2
Bracken	2.2	Bioinformatics	Sapelo2
braker	2.0.5, 2.1.2	Bioinformatics	Sapelo2
BreakDancer	1.4.5	Bioinformatics	Sapelo2
breseq	0.34.1	Bioinformatics	Sapelo2
BS-Seeker2	2.1.5	Bioinformatics	Sapelo2
BUSCO	2.0, 3.0.2, 4.0.5, 4.0.6	Bioinformatics	Sapelo2
BWA	0.7.15, 0.7.17	Bioinformatics	Sapelo2
Caffe	04082018	Other	Sapelo2
cactus	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
cairo	1.14.6, 1.14.10, 1.14.12	Bioinformatics	Sapelo2
Canu	1.7, 1.7.1, 1.8, 1.9	Bioinformatics	Sapelo2
CAP-miRSeq	05/20184	Bioinformatics	Sapelo2
CAP3	03092015	Bioinformatics	Sapelo2
cBar	1.2	Bioinformatics	Sapelo2
CD-HIT	4.6.1-2012-08-27, 4.6.8	Bioinformatics	Sapelo2
CDNA_Cupcake	5.9, 7.2, 8.4	Bioinformatics	Sapelo2
CDO	1.9.7	Other	Sapelo2
CellProfiler	3.1.8	Bioinformatics	Sapelo2
Cellrange	3.0.1, 3.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
CENSOR	4.2.29	Bioinformatics	Sapelo2
CFITSIO	3.38	Library	Sapelo2
CFOUR	1.2, 2.00-beta, 2.1	Chemistry	Sapelo2
CGAL	4.11	Library	Sapelo2
Cgmaptools	0.1.1	Bioinformatics	Sapelo2
Cgview_comparison_tool	2017.09.19	Bioinformatics	Sapelo2
CheckM	1.0.12	Bioinformatics	Sapelo2
Chimera	1.13	Bioinformatics	Sapelo2
Chromosomer	0.1.3, 0.1.4a0	Bioinformatics	Sapelo2
circlator	1.5.3	Bioinformatics	Sapelo2
Circos	0.69-6	Bioinformatics	Sapelo2
Cleaveland4	4.4	Bioinformatics	Sapelo2
Click	7.0	Other	Sapelo2
ClonalFrameML	1.11	Bioinformatics	Sapelo2
ClonalOrigin	0.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
Clust	1.9.0	Bioinformatics	Sapelo2
ClustAGE	0.8	Bioinformatics	Sapelo2
Clustal-Omega	1.2.4	Bioinformatics	Sapelo2
ClustalW2	2.1	Bioinformatics	Sapelo2
CMake	3.0.0, 3.4.3, 3.5.2, 3.6.1, 3.6.2, 3.7.2, 3.8.0, 3.9.1, 3.9.5, 3.10.2	Other	Sapelo2
CNIT	2020-05-13	Bioinformatics	Sapelo2
CNVnator	0.3.3, 0.4.1	Bioinformatics	Sapelo2
Cogent	3.5, 3.9, 6.0	Bioinformatics	Sapelo2
Coinfinder	1.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
CONCOCT	1.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
Consed	29.0	Bioinformatics	Sapelo2
cooler	0.8.5	Bioinformatics	Sapelo2
CPLEX	12.6.3	Engineering	Sapelo2
crest	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
CRISPResso	1.0.13	Bioinformatics	Sapelo2
CUDA	7.0.28, 7.5.18, 8.0.61, 8.0.61_375.26-GCC-5.4.0-2.26, 9.0.176, 9.1.85, 9.2.88, 10.0.130, 10.1.243	Programming	Sapelo2
cuDNN	7.0.4, 7.2.1.38, 7.4.2.24	Programming	Sapelo2
Cufflinks	2.2.1	Bioinformatics	Sapelo2
cURL	7.49.1	Other	Sapelo2
cutadapt	1.9.1, 1.14, 1.16, 2.6	Bioinformatics	Sapelo2
Cython	0.27.3, 0.28.5	Programming	Sapelo2
CythonGSL	0.2.2	Other	Sapelo2
Cytoscape	3.7.2, 3.8.0	Bioinformatics	Sapelo2
Dadi	1.7.0, 2.0.2	Bioinformatics	Sapelo2
Danpos2	2.2.2	Bioinformatics	Sapelo2
Darknet	3	Other	Sapelo2
DAS_Tool	1.1.1	Bioinformatics	Sapelo2
datamash	1.7	Other	Sapelo2
DBG2OLC	20170208	Bioinformatics	Sapelo2
DDocent	2.7.8	Bioinformatics	Sapelo2
DDSCAT	7.3.2	Chemistry	Sapelo2
decontaMiner	1.2	Bioinformatics	Sapelo2
deepTools	3.0.2, 3.2.1, 3.3.1	Bioinformatics	Sapelo2
DeepVariant	0.7.0	Bioinformatics	Sapelo2
Delft3d	20190610	Other	Sapelo2
delineate	1.2.2	Bioinformatics	Sapelo2
DendroPy	4.3.0, 4.4.0	Bioinformatics	Sapelo2
detectMITE	20170425	Bioinformatics	Sapelo2
detonate	1.11	Bioinformatics	Sapelo2
DIAMOND	0.8.31, 0.9.19, 0.9.22, 0.9.24, 0.9.31	Bioinformatics	Sapelo2
DISCOVARdenovo	52488	Bioinformatics	Sapelo2
DIYABC	2.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
DiscoVista	20190429	Bioinformatics	Sapelo2
Distruct	2.2	Bioinformatics	Sapelo2
DLCpar	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
Domainoid	20200127	Bioinformatics	Sapelo2
Doxygen	1.8.7, 1.8.11, 1.8.13	Other	Sapelo2
dRep	2.3.0	Bioinformatics	Sapelo2
DSSP	3.0.7	Bioinformatics	Sapelo2
DyNet	2.1	Other	Sapelo2
EDGE-pro	1.3.1	Bioinformatics	Sapelo2
EggNOG-Mapper	1.0.3, 2.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
Eigen	3.2.3, 3.3.5	Library	Sapelo2
EIGENSOFT	6.1.4, 7.2.1	Bioinformatics	Sapelo2
EMBOSS	6.6.0	Bioinformatics	Sapelo2
EMMAX beta	beta	Bioinformatics	Sapelo2
Ensembl-VEP	20180914	Bioinformatics	Sapelo2
EnTAP	0.8.4 beta	Bioinformatics	Sapelo2
epic2	0.0.36	Bioinformatics	Sapelo2
EricScript	0.5.5	Bioinformatics	Sapelo2
ESMF	7.0.2	Other	Sapelo2
eSpeak	1.48.04	Other	Sapelo2
Ete	3.1.1	Bioinformatics	Sapelo2
EVcouplings	0.0.5	Bioinformatics	Sapelo2
EVidenceModeler	0.1.3	Bioinformatics	Sapelo2
Exonerate	2.4.0	Bioinformatics	Sapelo2
FALCON	02282018_unzip	Bioinformatics	Sapelo2
Fast-Plast	1.2.6, 1.2.8	Bioinformatics	Sapelo2
FASTA	36.3.5e	Bioinformatics	Sapelo2
fast-GeP	1.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
FastME	2.1.5	Bioinformatics	Sapelo2
FastQC	0.11.5,0.11.8	Bioinformatics	Sapelo2
FastQValidator	0.1.1a	Bioinformatics	Sapelo2
FastQ_Screen	0.14.0	Bioinformatics	Sapelo2
FastSTRUCTURE	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
FastTree	2.1.10	Bioinformatics	Sapelo2
FastViromeExplorer	20180918	Bioinformatics	Sapelo2
FASTX-Toolkit	0.0.14	Bioinformatics	Sapelo2
FFmpeg	3.1.3, 3.4.1	Other	Sapelo2
FFTW	3.3.4, 3.3.6, 3.3.7	Math Library	Sapelo2
FIAT	1.6.0	Other	Sapelo2
fineSTRUCTURE	2.1.3	Bioinformatics	Sapelo2
FLASH	1.2.11	Bioinformatics	Sapelo2
FLTK	1.3.4	Other	Sapelo2
Flye	2.3.6, 2.6	Bioinformatics	Sapelo2
FoX	4.1.2	Library	Sapelo2
Freebayes	1.2.0, 1.3.2	Bioinformatics	Sapelo2
freesasa	2.0.3	Bioinformatics	Sapelo2
FriBidi	1.0.1	Library	Sapelo2
Funannotate	1.5.0	Bioinformatics	Sapelo2
FuzzyWuzzy	0.17.0	Other	Sapelo2
fxtract	2.3	Bioinformatics	Sapelo2
g2gtools	0.2.9	Bioinformatics	Sapelo2
GAG	2.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
GAMESS	14Feb2018	Chemistry	Sapelo2
GapFiller	2.1.1	Bioinformatics	Sapelo2
GAPIT	20180524	Bioinformatics	Sapelo2
GAPPadder	0.1	Bioinformatics	Sapelo2
GARLI	2.01	Bioinformatics	Sapelo2
GATK	3.4-0, 3.8-0, 3.8-1, 4.0.3.0, 4.0.11.0, 4.1.0.0, 4.1.2.0, 4.1.5.0, 4.1.6.0	Bioinformatics	Sapelo2
GAUSSIAN	09, 16	Chemistry	Sapelo2
GAUSSIAN	16	Chemistry	Teaching
GaussView	5, 6.1	Chemistry	Sapelo2
GaussView	6.1	Chemistry	Teaching
GBlocks	0.91b	Bioinformatics	Sapelo2
GCTA	1.26.0, 1.93.0-beta	Bioinformatics	Sapelo2
GD	2.66	Bioinformatics	Sapelo2
GDAL	2.1.0, 2.2.2	Library	Sapelo2
gdc-client	1.3.0	Bioinformatics	Sapelo2
Gdk-pixbuf	2.36.0	Library	Sapelo2
GEAN	0.1	Bioinformatics	Sapelo2
GEM	1.0, 1.1	Bioinformatics	Sapelo2
GEM-library	20130406-045632	Bioinformatics	Sapelo2
GeneMark.hmm.eukaryotic	4.30	Bioinformatics	Sapelo2
GeneMarkES	4.33, 4.57	Bioinformatics	Sapelo2
GeneMarkS-T	4.33	Bioinformatics	Sapelo2
GeneMarkS	4.30	Bioinformatics	Sapelo2
GenericRepeatFinder	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
GenMap	1.0.1	Bioinformatics	Sapelo2
Genocore	2020-05-13	Bioinformatics	Sapelo2
Genome	Phred version: 0.071220.c, Phrap version: 0.990329, Consed version: 29.0	Bioinformatics	Sapelo2
GenomeTools	1.5.9	Bioinformatics	Sapelo2
Genrich	0.5, 0.6	Bioinformatics	Sapelo2
GEOS	3.6.2	Library	Sapelo2
GET_HOMOLOGUES	1.7.6	Bioinformatics	Sapelo2
GET_PHYLOMARKERS	1.2.11, 1.3.1	Bioinformatics	Sapelo2
gfaviz	1.0.0	Other	Sapelo2
Gffcompare	0.10.4	Bioinformatics	Sapelo2
gffread	0.9.12	Bioinformatics	Sapelo2
GFlow	0.1.7	Library	Sapelo2
Ghostscript	9.20, 9.22	Other	Sapelo2
GISTIC	2.0.3	Bioinformatics	Sapelo2
Gkin	1.1	Bioinformatics	Sapelo2
GL2PS	1.4.0	Library	Sapelo2
GLib	2.49.5, 2.53.5, 2.54.3	Library	Sapelo2
GLIMMER	3.02b	Bioinformatics	Sapelo2
GLPK	4.63, 4.65	Programming	Sapelo2
GMAP-GSNAP	2016-11-07, 2018-07-04	Bioinformatics	Sapelo2
GMP	4.3.2, 6.1.1, 6.1.2	Library	Sapelo2
gnuplot	5.0.5	Graphics	Sapelo2
GObject-Introspection	1.49.1, 1.54.1	Other	Sapelo2
grace	5.1.25	Graphics	Sapelo2
GraftM	0.11.1	Bioinformatics	Sapelo2
GraphicsMagicK	1.3.28	Other	Sapelo2
Graphviz	2.40.1	Other	Sapelo2
GROCSVs	0.2.5	Bioinformatics	Sapelo2
Gromacs	2016.4, 2018.1	Chemistry	Sapelo2
GSL	1.16, 2.1, 2.3. 2.4, 2.5	Math Library	Sapelo2
GStreamer	1.14.0	Bioinformatics	Sapelo2
GTDBTk	0.2.2, 1.0.2	Bioinformatics	Sapelo2
gtftogenepred	377-3	Bioinformatics	Sapelo2
GTK+	2.24.31	Library	Sapelo2
GTS	0.7.6	Library	Sapelo2
Guile	1.8.8	Other	Sapelo2
h5py	2.7.1	Other	Sapelo2
HapCUT	0.7	Bioinformatics	Sapelo2
HapCUT2	20190606	Bioinformatics	Sapelo2
HarfBuzz	1.3.1, 1.7.5	Other	Sapelo2
HARP	140925_103521	Bioinformatics	Sapelo2
HarvestTools	1.2	Bioinformatics	Sapelo2
HH-suite	3.0-beta.3	Bioinformatics	Sapelo2
HiC-Pro	2.11.0-beta	Bioinformatics	Sapelo2
Hinge	0.5.0-4-deb_cv1	Bioinformatics	Sapelo2
hindex	1.42	Bioinformatics	Sapelo2
HISAT2	2.1.0	Bioinformatics	Sapelo2
HMMER	2.3, 3.1b2, 3.2.1	Bioinformatics	Sapelo2
Homer	4.9.1, 4.10, 4.11	Bioinformatics	Sapelo2
HPCGridRunner	1.0.2	Tools	Sapelo2
htop	2.0.1	Other	Sapelo2
HTSeq	0.9.1	Bioinformatics	Sapelo2
HTSlib	1.3.2, 1.6, 1.8	Library	Sapelo2
HTStream	1.3.0	Bioinformatics	Sapelo2
HUMAnN2	0.11.2	Bioinformatics	Sapelo2
HybPiper	1.3.1	Bioinformatics	Sapelo2
HyPhy	2.5.15	Bioinformatics	Sapelo2
Hypre	2.11.1	Library	Sapelo2
ICORN2	0.95	Bioinformatics	Sapelo2
IDBA-UD	1.1.3	Bioinformatics	Sapelo2
IDR	2.0.2	Bioinformatics	Sapelo2
IgBlast	1.16.0	Bioinformatics	Sapelo2
IGV	2.4.4	Bioinformatics	Sapelo2
IGVTools	2.3.98	Bioinformatics	Sapelo2
illumiprocessor	2.0.9	Bioinformatics	Sapelo2
ImageMagick	7.0.5, 7.0.7	Other	Sapelo2
Infernal	1.1.2	Bioinformatics	Sapelo2
IonCom	20190521	Bioinformatics	Sapelo2
iprscan (InterProScan)	5.29-68.0, 5.31-70.0, 5.32-71.0, 5.41-78.0, 5.44-90.0	Bioinformatics	Sapelo2
ipyrad	0.7.24, 0.7.28, 0.7.30, 0.9.19	Bioinformatics	Sapelo2
IPython	5.3.0, 6.2.1, 7.5.0	Other	Sapelo2
IQ-Tree	1.5.5, 1.6.5, 1.6.12	Bioinformatics	Sapelo2
IRMA	0.6.7, 0.9.3	Bioinformatics	Sapelo2
ISGPipeline	0.16.10-3	Bioinformatics	Sapelo2
IsONclust	0.0.4	Bioinformatics	Sapelo2
IsoSeq3	3.1.2	Bioinformatics	Sapelo2
ITSTool	2.0.4	Utility	Sapelo2
JAGS	4.3.0	Statistics	Sapelo2
JasPer	1.900.1, 2.0.12	Other	Sapelo2
Java	1.8.0_92, 1.8.0_112, 1.8.0_121, 1.8.0_141, 1.8.0_144, 1.8.0_202	Programming	Sapelo2
Java	1.8.0_144, 1.8.0_241, 11.0.2	Programming	Teaching
jcvi	0.8.12	Bioinformatics	Sapelo2
Jellyfish	2.2.6	Bioinformatics	Sapelo2
JModelTest	2.1.10	Bioinformatics	Sapelo2
Juicer	1.5.6	Bioinformatics	Sapelo2
Julia	1.3.1	Programming	Sapelo2
JUnit	4.12	Other	Sapelo2
Jupyter	4.3.0	Other	Sapelo2
Kaiju	1.6.2, 1.7.3	Bioinformatics	Sapelo2
kallisto	0.43.1, 0.46.0	Bioinformatics	Sapelo2
KAT	2.4.1	Bioinformatics	Sapelo2
Kent_tools	20190208, 20200512	Bioinformatics	Sapelo2
keras	2.0.6, 2.2.2	Other	Sapelo2
KinFin	1.0.3	Bioinformatics	Sapelo2
KmerGenie	1.7044	Bioinformatics	Sapelo2
Kraken2	2.0.7-beta	Bioinformatics	Sapelo2
KronaTools	2.7	Bioinformatics	Sapelo2
LAME	3.100	Other	Sapelo2
LAMMPS	30Jul16, 11Aug17	Chemistry	Sapelo2
LAPACK	3.6.1	Other	Sapelo2
LAST	956, 959, 1047	Bioinformatics	Sapelo2
LASTZ	1.04.00	Bioinformatics	Sapelo2
LDhat	2.2	Bioinformatics	Sapelo2
LDhelmet	1.10	Bioinformatics	Sapelo2
Leafcutter	0.2.8	Bioinformatics	Sapelo2
Lep-MAP3	0.2	Bioinformatics	Sapelo2
libssh2	1.9.0	Other	Sapelo2
LibStatGen	1.0.14	Bioinformatics	Sapelo2
LibTIFF	4.0.6, 4.0.8, 4.0.9	Library	Sapelo2
LINKS	1.8.7	Bioinformatics	Sapelo2
LittleCMS	2.8	Other	Sapelo2
LLVM	3.8.1, 4.0.0, 5.0.1, 6.0.0	Library	Sapelo2
LMDB	0.9.22	Bioinformatics	Sapelo2
LoFreq	2.1.2	Bioinformatics	Sapelo2
Log-Log4perl	1.49	Other	Sapelo2
LongRanger	2.2.2	Bioinformatics	Sapelo2
LoRDEC	0.9	Bioinformatics	Sapelo2
LoRMA	0.5	Bioinformatics	Sapelo2
LRCstats	1.1	Bioinformatics	Sapelo2
lrslib	6.2	Other	Sapelo2
LS-DYNA	10.123355	Engineering	Sapelo2
LS-PrePost	4.5	Engineering	Sapelo2
LtrDetector	1.0	Bioinformatics	Sapelo2
LTR_Finder	1.0.7	Bioinformatics	Sapelo2
LTR_retriever	1.6	Bioinformatics	Sapelo2
LUMPY	0.2.13	Bioinformatics	Sapelo2
LZO	2.10	Bioinformatics	Sapelo2
M4	1.4.16, 1.4.17, 1.4.17	Other	Sapelo2
MacSyFinder	1.0.5	Bioinformatics	Sapelo2
MACS2	2.1.1, 2.1.2, 2.2.7.1	Bioinformatics	Sapelo2
MAFFT	7.273, 7.313, 7.397, 7.407, 7.453, 7.470	Bioinformatics	Sapelo2
Magic-BLAST	1.4.0	Bioinformatics	Sapelo2
Magma-GPU	2.3.0	Other	Sapelo2
Magma	2.22-9, 2.24-4, 2.25	Other	Sapelo2
mahotas	1.4.3	Bioinformatics	Sapelo2
MAJIQ	2.1	Bioinformatics	Sapelo2
Maker	3.01.02-beta,2.31.9, 2.31.10	Bioinformatics	Sapelo2
Mako	1.0.4, 1.0.7	Other	Sapelo2
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